| 基于SSR标记的六种野生猕猴桃亲缘关系分析 |
| |
| 引用本文： | 郭丽娜,方玉梅,韩世明,陈志霞.基于SSR标记的六种野生猕猴桃亲缘关系分析[J].北方园艺,2023(20):20-27. |
| |
| 作者姓名： | 郭丽娜 方玉梅 韩世明 陈志霞 |
| |
| 作者单位： | 六盘水师范学院生物科学与技术学院 |
| |
| 基金项目： | 贵州省科技计划资助项目(黔科合基础[2019]1446号)；;贵州省教育厅自然科学研究资助项目(黔教技[2022]054号)； |
| |
| 摘 要： | 以贵州6种野生猕猴桃36个居群为试材，采用生物信息学方法，对“红阳”猕猴桃应答橘小实蝇侵害的转录组数据进行SSR位点搜索，开发EST-SSR引物后，研究了36个野生猕猴桃居群180份种质的遗传多样性与亲缘关系，以期为合理保护及开发利用野生猕猴桃资源提供参考依据。结果表明：“红阳”猕猴桃果实EST-SSR的分布频率为43.07%,6种重复类型的重复次数分布在5～24次，优势重复类型为二核苷酸，占总SSR位点的69.19%。参试的40对EST-SSR引物中有28对引物均可在6种野生猕猴桃中扩增出目的条带，在180个猕猴桃种质中共检测出了348个等位基因位点。多态性信息含量(PIC)在0.376 6(引物：P3-22)～0.930 4(引物：P4-37),平均为0.783 6,其中只有1对引物为中等多态性引物，其它均为高多态性引物。聚类分析显示，6种野生猕猴桃在遗传距离0.72处可分成2个类群，黄毛猕猴桃、毛花猕猴桃、阔叶猕猴桃被归为一类，京梨猕猴桃、异色猕猴桃、硬毛猕猴桃为一类。
|
| 关 键 词： | 猕猴桃 转录组 SSR标记 遗传多样性 聚类分析 |
|
|
