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黄鳝抗菌肽hepcidin基因cDNA的克隆及表达分析
引用本文:李伟,孙文秀,熊涛.黄鳝抗菌肽hepcidin基因cDNA的克隆及表达分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2009,35(3).
作者姓名:李伟  孙文秀  熊涛
作者单位:长江大学,生命科学学院,湖北,荆州,434025
基金项目:湖北省教育厅青年项目,长江大学博士启动基金 
摘    要:根据已知鱼类抗菌肽hepcidin的同源性设计简并引物,利用同源克隆结合RACE法从黄鳝(Monopterus albus)肝脏中扩增得到了黄鳝hepcidin基因全长cDNA序列(GenBank accession number FJ436808).结果表明,黄鳝hepcidin基因cDNA全长712 bp,5′端非翻译区有133 bp,3′端非翻译区有306 bp,包含1个273 bp的开放阅读框,编码1个长90氨基酸的前体肽.同源性分析表明,黄鳝hepcidin推测的氨基酸序列与其他鱼类报道的hepcidin具有较高的同源性,并具有8个半胱氨酸这一典型特征,是hepcidin家族的1个新成员.采用半定量PCR法对该基因在健康成体不同组织的转录本和脂多糖(LPS)对该基因表达的影响进行了分析.结果发现,该基因在肝脏中表达量最高,其次是肾脏,在心脏、皮肤、脑、血液、小肠、脾脏和胃中的表达量较低,而在肌肉中没有检测到该基因的转录本;LPS注射24 h后,各组织的hepcidin基因表达量都有明显升高.

关 键 词:黄鳝  抗菌肽  hepcidin基因  克隆  表达分析

Molecular cloning and expression analysis of a hepcidin gene from rice field eel (Monopterus albus)
LI Wei,SUN Wen-xiu,XIONG Tao.Molecular cloning and expression analysis of a hepcidin gene from rice field eel (Monopterus albus)[J].Journal of Hunan Agricultural University,2009,35(3).
Authors:LI Wei  SUN Wen-xiu  XIONG Tao
Institution:College of Life Science;Yangtze University;Jingzhou;Hubei 434025;China
Abstract:Based on the homology of known hepcidin,a pair of degenerate primers were designed,and a molecular cloning of a hepcidin gene from the liver of a rice field eel was conducted.The full-length cDNA of the gene(GenBank accession number:FJ436808) was identified by RT-PCR and RACE.It is 712 bp long flanked by a 133 bp of 5'-untranslated region and a 306 bp of 3'-untranslated region.and containing an ORF of 273 bases encoding a prepropeptide of 90 amino acid residues.Homologous analysis indicated that deduced ami...
Keywords:Monopterus albus  antimicrobial peptides  hepcidin gene  cloning  gene expression
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