| 苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析 |
| |
| 引用本文： | 韩大勇,周春宝,倪黎纲,陈章言,赵锦明.苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析[J].中国畜牧兽医,2023(4):1472-1479. |
| |
| 作者姓名： | 韩大勇 周春宝 倪黎纲 陈章言 赵锦明 |
| |
| 作者单位： | 1. 江苏农牧科技职业学院;2. 江苏姜曲海种猪场 |
| |
| 摘 要： | 【目的】通过对苏姜猪线粒体DNA(mtDNA) D-loop高变区Ⅰ的序列扩增测序，探究苏姜猪种群的种质资源特性和遗传多样性。【方法】采集苏姜猪核心群100头经产母猪耳组织，提取DNA后扩增苏姜猪核心群母猪mtDNA D-loop高变区Ⅰ的基因片段并测序，运用NCBI在线BLAST对测序序列与参考序列进行比对、校正并寻找同源序列，确定mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列的长度和位置；使用DnaSP v.5.10.1软件统计获得群体中核苷酸多态位点和变异位点数量，分析单倍型多样度(Hd)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异度(K)等参数；使用Mega 7.0软件对不同单倍型进行基于Kimura’s 2-prarmetermodel的遗传距离计算，采用邻接法(Neighbor-Joining, NJ)对苏姜猪的4个单倍型、17个中国地方猪种、欧洲家猪(登录号：AF034253.1)的mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列构建系统发育树。【结果】对100头苏姜猪的mtDNA D-loop序列高变区Ⅰ进行扩增测序，获得长度为429 bp的有效序列，获得的序列中，AT含量为63.1%,GC含量为...
|
| 关 键 词： | 苏姜猪 线粒体DNA D-loop区 遗传变异 单倍型多样度 核苷酸多样性 |
|
|
