| 1株J亚群禽白血病病毒env基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈玫婷,郑从森,梁泽贤,林巧儿,常传哲,周俊,冯军,李林林,覃丽梅.1株J亚群禽白血病病毒env基因克隆及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2023(5):1785-1795. |
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| 作者姓名： | 陈玫婷 郑从森 梁泽贤 林巧儿 常传哲 周俊 冯军 李林林 覃丽梅 |
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| 作者单位： | 1. 佛山科学技术学院生命科学与工程学院;2. 广东省农业科学院动物卫生研究所 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金面上项目(2021A1515012388)； |
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| 摘 要： | 【目的】通过生物信息学方法分析1株禽白血病病毒(Avian Leukosis virus, ALV)的囊膜蛋白env的分子特征。【方法】利用鸡成纤维细胞(DF-1)培养疑似禽白血病病鸡的血清样品，通过ELISA和实时荧光定量PCR鉴定ALV亚群。对env基因PCR产物进行测序，利用SeqMan拼接env基因。将该env基因与国内外多个ALV亚群进行序列比对及遗传进化分析，并借助多种生物信息学软件对env蛋白进行分析，包括理化性质、亲/疏水性、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、乙酰化位点、二级结构、三级结构、抗原决定簇和B细胞抗原表位预测。【结果】ALV-J毒株的env基因全长1 719 bp,获得GenBank登录号为OP837418,其与J亚群ALV位于同一进化分支，相似性为89.3%～94.8%。该env蛋白有2个跨膜区，是由572个氨基酸组成的不稳定的亲水蛋白，不稳定系数预测值为43.49,总平均亲水性为―0.201;该env蛋白为非分泌蛋白，无信号肽，有17个N-糖基化修饰位点、77个O-糖基化修饰位点、42个磷酸化修饰位点、21个潜在抗原决定簇和9个连续碱基数超过10个...
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| 关 键 词： | 禽白血病病毒(ALV) J亚群 env基因 生物信息学 |
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