| 大白猪仔猪感染流行性腹泻病毒后空肠转录组学变化研究 |
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| 引用本文： | 李慧慧,张美美,元娜,张龙超,王立贤,石丽君.大白猪仔猪感染流行性腹泻病毒后空肠转录组学变化研究[J].中国畜牧兽医,2023(10):4141-4149. |
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| 作者姓名： | 李慧慧 张美美 元娜 张龙超 王立贤 石丽君 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;2. 北京大伟嘉生物技术股份有限公司 |
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| 摘 要： | 【目的】猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea, PED)的广泛流行给猪场造成了严重损失。现有疫苗对其变异毒株的防控作用非常有限，从宿主角度筛选的有效免疫相关分子标记仍然缺乏。本研究旨在鉴定感染和未感染猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的大白猪仔猪空肠组织差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),为PEDV致病机制研究奠定基础。【方法】以8头未吃初乳的0日龄大白猪为试验动物，使用人工乳饲喂至3日龄，随机挑选4头进行攻毒(感染组),其余4头作为对照组。收集感染后死亡及对照组仔猪的空肠组织进行转录组测序。通过差异表达分析筛选与病毒复制及机体免疫应答相关的基因，对DEGs进行GO功能和KEGG通路注释，并随机挑选5个DEGs进行实时荧光定量PCR验证。【结果】通过对测序数据质控、比对等分析共鉴定到16 256个蛋白编码基因(protein coding genes, PCGs),通过差异分析鉴定到1 328个DEGs,其中629个表达上调，699个表达下调。G...
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| 关 键 词： | 大白猪仔猪 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 转录组 功能富集 |
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