绵羊miR-449a/b前体序列组织表达及生物信息学分析 |
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引用本文: | 王赛桥,赵路,翟振翰,张丙雷,贾万航,王玉琴.绵羊miR-449a/b前体序列组织表达及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2023(6):2175-2184. |
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作者姓名: | 王赛桥 赵路 翟振翰 张丙雷 贾万航 王玉琴 |
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作者单位: | 河南科技大学动物科技学院 |
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基金项目: | 财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-38); |
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摘 要: | 【目的】探究miR-449a/b在绵羊生长发育和繁殖性能方面的作用,为进一步研究miR-449a/b在绵羊繁殖调控中的作用提供参考。【方法】以湖羊为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术鉴定miR-449a/b在湖羊下丘脑、垂体和卵巢中的相对表达量。使用TargetScan、miRWalk、miRDB软件预测绵羊miR-449a/b前体序列的靶基因,利用微生信和KOBAS网站对其进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】试验获得的前体序列与NCBI数据库中绵羊前体序列信息比对结果一致。实时荧光定量PCR结果显示,miR-449a在垂体中的相对表达量显著高于miR-449b(P<0.05),miR-449b在卵巢中的相对表达量极显著高于miR-449a(P<0.01)。利用3个靶基因预测软件做韦恩图分析,取其交集得到miR-449a/b的靶基因数目分别为299和23个。GO功能富集显示,miR-449a/b主要被富集到生物进程;KEGG通路富集结果取前20个通路进行分析发现,主要包括催产素、MAPK等与繁殖调控相关的信号通路。【结论】miR-449a在垂体中的表达量较高,mi...
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关 键 词: | 绵羊 miR-449a miR-449b 生物信息学 靶基因 繁殖调控 |
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