| 无量山乌骨鸡HMOX1基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 |
| |
| 引用本文： | 殴小嫚,刘明欢,吴芸,郭爱伟,李秋玉,陈粉粉.无量山乌骨鸡HMOX1基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究[J].中国畜牧兽医,2023(11):4381-4391. |
| |
| 作者姓名： | 殴小嫚 刘明欢 吴芸 郭爱伟 李秋玉 陈粉粉 |
| |
| 作者单位： | 1. 西南林业大学生命科学学院;2. 遵义师范学院生物与农业科技学院;3. 石屏县动物疫病预防控制中心 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32060739)； |
| |
| 摘 要： | 【目的】扩增无量山乌骨鸡血红素加氧酶1(heme oxygenase 1,HMOX1)基因CDS区并进行生物信息学分析，检测其组织表达特征，为后续该基因的功能研究奠定基础。【方法】以无量山乌骨鸡皮下脂肪组织cDNA为模板，PCR扩增HMOX1基因，连接PESI-T载体后进行测序分析，使用DNAMAN软件对所获序列进行翻译并与原鸡进行序列比对；使用BLAST、Mega 7.0、SOPMA、ProtParam和ExPASy等在线软件进行相似性比对、系统进化树构建、编码蛋白的理化性质及蛋白结构预测；利用STRING软件预测HMOX1互作蛋白；通过实时荧光定量PCR检测HMOX1基因在无量山乌骨鸡不同组织中的表达水平。【结果】无量山乌骨鸡HMOX1基因CDS区长为891 bp,编码296个氨基酸，与原鸡HMOX1基因(登录号：NM＿205344.1)核苷酸序列相比存在3处突变，其中2处为同义突变，第217 bp处G>C为错义突变，导致第73位的天冬氨酸突变为甘氨酸。HMOX1基因与原鸡和日本鹌鹑的氨基酸序列相似性较高(99.6%和95.0%),与马的相似性最低(60.2%)。系统进化树分...
|
| 关 键 词： | 无量山乌骨鸡 HMOX1基因 克隆 生物信息学 组织表达 |
|
|
