水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 范冰峰,李文,刘理想,赵向远,邵静,林乐丰,孙慧敏,张旭林,许保增.水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2023(4):1307-1318. |
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作者姓名: | 范冰峰 李文 刘理想 赵向远 邵静 林乐丰 孙慧敏 张旭林 许保增 |
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作者单位: | 中国农业科学院特产研究所 |
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基金项目: | 吉林省国际科技合作(20170414049GH);;吉林省自然科学基金(YDZJ202201ZYTS450); |
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摘 要: | 【目的】试验旨在对美洲水貂(Neovison vison)褪黑素(N-acetyl-5-methoxytryptamine, MT)合成的限速酶5-羟色胺-N-乙酰基转移酶(aralkylamine N-acetyltransferase, AANAT)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究AANAT基因在水貂中的生物学功能提供参考。【方法】对水貂尾静脉采血后提取DNA,利用同源重组的方法克隆AANAT基因并分析其编码区(CDS)序列,推导成氨基酸序列后进行相似性比对及系统进化树构建,并对AANAT蛋白进行生物信息学分析。【结果】水貂AANAT基因序列长约1 631 bp, CDS区长504 bp,可编码167个氨基酸。水貂AANAT氨基酸序列与雪貂相似性最高(98.2%),系统进化树分析也显示其与雪貂亲缘关系最近。生物信息学分析结果表明,水貂AANAT蛋白为疏水性蛋白,无跨膜结构域和信号肽,主要分布于细胞质中,有5个抗原结合位点为非分泌型蛋白,该蛋白含有多个磷酸化、糖基化等翻译后修饰位点。AANAT蛋白含有1个保守的N-酰基转移酶超家族结构域,该家族与哺乳动物的昼夜节律密切相关。AAN...
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关 键 词: | 水貂 AANAT基因 克隆 生物信息学分析 蛋白结构 |
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