基于免核酸提取可视化RT-LAMP快速检测黄瓜绿斑驳花叶病毒 |
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引用本文: | 尹新颖,曹际娟,李 鑫,杨莉莉,朴永哲.基于免核酸提取可视化RT-LAMP快速检测黄瓜绿斑驳花叶病毒[J].植物保护,2023,49(2):264-271. |
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作者姓名: | 尹新颖 曹际娟 李 鑫 杨莉莉 朴永哲 |
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作者单位: | YIN Xinying1, CAO Jijuan1*, LI Xin2, YANG Lili1, PIAO Yongzhe1 |
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基金项目: | 大连市高层次人才创新支持计划(2019CT09) |
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摘 要: | 本文基于逆转录环介导恒温扩增(RT-LAMP)技术建立葫芦科作物中黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)免核酸提取的可视化快速检测方法。根据CGMMV全基因组序列,筛选保守区域并设计特异性RT-LAMP检测引物。通过荧光扩增方法 (加SYTO-9)和可视化方法 (加钙黄绿素),开展RT-LMAP特异性、灵敏度和重现性试验分析。结果表明,优化筛选的引物组可以特异性地检测CGMMV,检测灵敏度达到4.21×103 fg/μL,组内和组间变异系数均小于5%,重现性好。对瓜类作物田间种苗、植株叶片及市售种子等103份样品进行检测及一致性分析,表明该方法与基于RNA提取RT-LAMP、荧光RT-qPCR及免疫测试条检测结果之间的Kappa值均为1.0 (1~1, 95%置信区间),具有很好的一致性。基于免核酸提取的可视化RT-LAMP快检方法成为适合现场快速检测的理想选择,对于CGMMV危害葫芦科作物的田间监测以及疫情防控具有广泛的推广应用前景。
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关 键 词: | 黄瓜绿斑驳花叶病毒 逆转录环介导恒温扩增(RT-LAMP) 可视化 免核酸提取 |
收稿时间: | 2021/11/26 0:00:00 |
修稿时间: | 2022/2/22 0:00:00 |
Rapid detection of cucumber green mottle mosaic virus based on visual RT-LAMP without nucleic acid extraction |
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Institution: | 1. Key Laboratory of Biotechnology and Bioresources Utilization of Ministry of Education, Dalian Minzu University, Dalian 116600, China; 2. Dalian Customs District, Dalian 116001, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) RT-LAMP visualization free nucleic acid extraction |
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