基于MHC\|DAB基因内含子序列的3种虹鳟养殖群体遗传结构分析 |
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引用本文: | 杨娟,刘山东,施海娜,胡丹丹,王建福,宋超.基于MHC\|DAB基因内含子序列的3种虹鳟养殖群体遗传结构分析[J].中国农业科技导报,2013,15(6):135-141. |
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作者姓名: | 杨娟 刘山东 施海娜 胡丹丹 王建福 宋超 |
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作者单位: | (1.甘肃农业大学动物科学技术学院, 兰州 730070,2.甘肃省渔业技术推广总站, 兰州 730070) |
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基金项目: | 甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW\|2011\|21)资助。 |
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摘 要: | 虹鳟是当前全球性养殖品种,采用PCR\|SSCP的方法,分析了甘肃金鳟、道氏虹鳟和美国金鳟三个虹鳟养殖群体各30个个体MHC\|DAB基因第2内含子序列(308 bp)的遗传变异。108个阳性克隆经SSCP筛选及测序,共获得11种不同的核苷酸序列(Ⅰ~Ⅺ),单个个体最多存在4种等位基因。等位基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅵ是三个群体共有的;Ⅳ仅存在于道氏虹鳟中;Ⅶ仅存在于甘肃金鳟中;Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ仅存在于美国金鳟中。甘肃金鳟、道氏虹鳟、美国金鳟群体内核苷酸多态位点分别为17个、19个、22个,核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.005、0.008、0.013,平均核苷酸位点差异数(K)分别为1.200、2.000、3.333。甘肃金鳟群体与道氏虹鳟群体间的遗传距离最小(0.231),与美国金鳟群体间的遗传距离最大(0.539),三个群体间的遗传分化均达到了种群的分化标准(D>0.05)。群体遗传分化系数GST为0.097,表明变异主要来源于群体内个体间。
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关 键 词: | 虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 遗传结构 遗传分化 MHC |
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