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番木瓜果实酵母双杂交文库的构建及CpMYB114L互作蛋白的筛选
引用本文:周陈平,杨 敏,郭金菊,等.番木瓜果实酵母双杂交文库的构建及CpMYB114L互作蛋白的筛选[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2022,50(7):127-137.
作者姓名:周陈平  杨 敏  郭金菊  
作者单位:广东省农业科学院 果树研究所,农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室,广东省热带亚热带果树研究重点实验室;广东省农业科学院 设施农业研究所
基金项目:国家自然科学基金项目(32102355);广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目(优稀水果)(2021KJ116);广州市科技计划项目(202102020038);广东省基础与应用基础研究基金项目(2020A1515011166);广东省农业科学院院长基金项目(202011)
摘    要:【目的】从番木瓜4个不同成熟期果实的转录组中筛选并克隆得到1个转录因子CpMYB114L,构建番木瓜果实的cDNA文库,筛选与CpMYB114L互作的蛋白,探究CpMYB114L参与调控果实成熟的分子机理。【方法】以番木瓜‘GZBG’品种的果实为材料,设计特异引物,克隆CpMYB114L CDS区,利用生物信息学软件分析该基因序列及其编码的蛋白序列。提取番木瓜不同成熟期果实的总RNA,利用all-direct法建立酵母双杂交cDNA文库。构建pGBKT7-CpMYB114L诱饵载体,对其自激活检测后,通过共转化从文库中筛选CpMYB114L互作蛋白。通过在NCBI网站上进行序列比对,明确互作蛋白的功能分类,最后对各类蛋白基因在番木瓜不同成熟期果实中的表达进行分析。【结果】CpMYB114L基因的CDS序列编码227个氨基酸,预测其相对分子质量为26 304.3,理论等电点为6.23,亲水性总平均值为-0.893。CpMYB114L蛋白序列与甜樱桃(PaWERL)、蒺藜苜蓿(MtMYB1)、黧豆(MpMYB113)、大豆(GmMYB1)和苹果(MdMYB308L)的同源性较近。cDNA文库总库容为1.15×107 CFU,重组率100%,插入片段长度为750~2 000 bp。诱饵载体pGBKT7-CpMYB114L不存在自激活。从酵母双杂交文库中筛选到30个初始阳性克隆,经回转验证后最终获得26个与CpMYB114L互作的蛋白,共分为4类,包括乙烯响应受体1(CpERS1)、酰基辅酶A硫酯酶13(CpAcots13)、热休克蛋白42(CpHSP42)和叶绿体转运子159(CpTOC159)。在果实成熟过程中,CpERS1和CpHSP42表达量先上升后下降,CpAcots13表达量持续上升,CpTOC159表达量剧增后趋于平稳。【结论】推测CpMYB114L与CpERS1蛋白互作参与番木瓜果实成熟的调控。

关 键 词:番木瓜  酵母双杂交  果实成熟  CpMYB114L  互作蛋白筛选
收稿时间:2021/8/20 0:00:00

Construction of yeast two-hybrid library and screening of CpMYB114L interacting protein in papaya fruit
ZHOU Chenping,YANG Min,GUO Jinju,et al.Construction of yeast two-hybrid library and screening of CpMYB114L interacting protein in papaya fruit[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2022,50(7):127-137.
Authors:ZHOU Chenping  YANG Min  GUO Jinju  
Abstract:
Keywords:papaya  yeast two-hybrid  fruit ripening  CpMYB114L  interaction protein screening
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