| 基于绵羊皮肤组织ESTs开发新型微卫星标记 |
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| 引用本文： | 王遵宝,努尔力·阿不力孜,赵宗胜,曾献存,吴洪宾.基于绵羊皮肤组织ESTs开发新型微卫星标记[J].中国农学通报,2010,26(3):42-45. |
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| 作者姓名： | 王遵宝 努尔力·阿不力孜 赵宗胜 曾献存 吴洪宾 |
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| 作者单位： | 石河子大学动物科技学院,新疆石河子,832003 |
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| 基金项目： | 国际科技合作项目"绵羊非繁殖季节产羔性状的QTL定位及相关基因的分离" |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法，在从国际公共生物数据库检索获得绵羊皮肤组织相关的3295条EST序列中筛选微卫星标记。结果表明,从绵羊皮肤组织相关的EST序列中搜索到微卫星209个,含有微卫星的序列196 个,占整个EST 序列数据库的6.3% , 其中双碱基重复150个,三碱基重复19个,四碱基重复12个,五碱基重复17个,六碱基重复11个。在这些微卫星序列中,AC/TG重复在双碱基类型中最丰富,占双碱基微卫星序列总数的71.8%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物22对 ,其中18 对引物有扩增产物,且条带清晰, 6对引物在中国美利奴羊群内多态性丰富,平均PIC达0.7001，为后期与毛品质进行相关性分析，寻找毛用性状新型分子标记奠定了基础。
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| 关 键 词： | 政治参与 政治参与 村委选举 有序Probit模型 南京 |
| 收稿时间： | 2009-10-13 |
| 修稿时间： | 2009-10-22 |
Identification of Microsatellites from Skin of Sheep |
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| Wang Zunbao,Nuerli·Abulizi,Zhao Zongsheng,Zeng Xiancun,Wu Hongbin.Identification of Microsatellites from Skin of Sheep[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2010,26(3):42-45. |
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| Authors: | Wang Zunbao Nuerli·Abulizi Zhao Zongsheng Zeng Xiancun Wu Hongbin |
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| Institution: | (College of Animal Science and Technology,Shihezi University,Shihezi Xinjiang 832003) |
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| Abstract: | 3,295 ESTs from NCBI were mined to develop EST-SSR markers.By using SSRHunter soft tools,a total of 209 SSRs were identified from 196 ESTs.The frequency of EST-SSRs was 6.3%.The dinucleotide repeat motif was the most abundant SSR,accounting for 67%,followed by 9.1%,8.1%,5.7%and 5.3%, respectively,for tri-,hexa-,penta- and tetra-nucleotide repeats.Among the di-nucleotide repeats,AC/TG (31%)were the most abundant type.22 primer pairs were designed from microsatellite,18 pairs could show clear PCR products by ... |
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| Keywords: | EST SSR |
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