| 红椿SRAP反应体系优化及引物筛选 |
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| 引用本文： | 李培,阙青敏,王芳,李俊成,朱芹,廖柏勇,陈晓阳.红椿SRAP反应体系优化及引物筛选[J].林业科学研究,2017,30(1):10-17. |
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| 作者姓名： | 李培 阙青敏 王芳 李俊成 朱芹 廖柏勇 陈晓阳 |
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| 作者单位： | 华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;嘉应学院, 广东 梅州 514015;华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室, 广东 广州 510642 |
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| 基金项目： | 国家林业局林业公益性行业科研专项（201004020）。 |
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| 摘 要： | 目的]优化相关序列扩增多态性(SRAP)体系内的不同组分,建立适用于红椿SRAP分子标记的反应体系,并进一步从SRAP引物组合中筛选出稳定、多态性好的引物组合,为红椿遗传多样性研究奠定试验基础。方法]针对SRAP-PCR反应体系中5个因素各设置8个水平,先利用单因素试验确定浓度梯度,后在确定的梯度范围内选定4个水平,按照正交试验L16(45)进行优化,结合正交直观分析法和新复极差法对各因素进行优化筛选。结果]确定最优体系为总体系25μL,模板DNA 25 ng,上下游引物各0.3μmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶1U,Mg2+2.5 mmol·L~(-1),d NTP 0.3 mmol·L~(-1)。利用稳定的SRAP-PCR体系,从1 505对SRAP引物组合中筛选出30对优质引物组合。结论]通过不同种源红椿基因组DNA的重复验证,获得了稳定清晰、多态性较强的扩增条带,表明所确定的最优体系稳定可靠,适用性较强,可用于不同种源红椿遗传多样性研究的后续实验。
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| 关 键 词： | 红椿 SRAP分子标记 反应体系 引物筛选 |
| 收稿时间： | 2016/2/29 0:00:00 |
Optimization and Primers Selection of SRAP-PCR System in Toona ciliata Roem |
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| LI Pei,QUE Qing-min,WANG Fang,LI Jun-cheng,ZHU Qin,LIAO Bo-yong and CHEN Xiao-yang.Optimization and Primers Selection of SRAP-PCR System in Toona ciliata Roem[J].Forest Research,2017,30(1):10-17. |
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| Authors: | LI Pei QUE Qing-min WANG Fang LI Jun-cheng ZHU Qin LIAO Bo-yong and CHEN Xiao-yang |
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| Institution: | Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;Jiaying University, Meizhou 514015, Guangdong, China;Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China;Guangdong Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Forest Plant Germplasm, College of Forestry and Landscape Architecture, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Toona ciliata Roem SRAP-PCR reaction system optimization |
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