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澳洲坚果MiSTPP6基因克隆及低温胁迫下表达分析
引用本文:蔡元保,杨祥燕,李季东,黄思婕,李穆,巫辅民.澳洲坚果MiSTPP6基因克隆及低温胁迫下表达分析[J].南方农业学报,2021,52(12):3205-3211.
作者姓名:蔡元保  杨祥燕  李季东  黄思婕  李穆  巫辅民
作者单位:广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁 530001
基金项目:国家自然科学基金项目(31860537);广西科技计划项目(桂科AB19245008);广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2021YT154,桂农科2020YM56)
摘    要:【目的】克隆澳洲坚果丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP1)家族基因(MiSTPP6),并分析其不同组织及低温胁迫下的表达模式,为澳洲坚果PP1家族基因的抗寒分子机制提供理论依据。【方法】基于澳洲坚果转录组测序结果,利用RT-PCR技术克隆MiSTPP6基因,对其序列进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR检测其在不同组织及低温胁迫下的表达情况。【结果】从澳洲坚果中克隆获得MiSTPP6基因(GenBank登录号为MT374553),其cDNA全长2129bp,最大的阅读框(ORF)长度为948bp,编码315个氨基酸残基,含有PP1蛋白家族的典型结构域(MPP_PP1_PPKL)和特征性序列(LRGNHE)。MiSTPP6蛋白为稳定的亲水性蛋白,以丝氨酸磷酸化为主,可能定位于细胞质,属于非分泌型蛋白或膜蛋白,与已知植物PP1蛋白的氨基酸序列具有很高的相似性。MiSTPP6蛋白的二级结构由α-螺旋(占40.00%)、无规则卷曲(占32.38%)、延伸链(占18.41%)和β-转角(占9.21%),其三级结构与模板蛋白4v0u.1.A的结构相似度为80.60%,GMQE值为0.89。MiSTPP6基因在根、茎、叶、刚开放的小花和谢花后30~45d的小果中均有表达,其中,MiSTPP6基因在刚开放的小花中的相对表达量最高。4 ℃低温胁迫后0.5~24.0h,MiSTPP6基因在澳洲坚果苗期叶片中的相对表达量较对照明显下调,整体上呈持续下降的趋势。【结论】MiSTPP6属于PP1家族基因,具有组织表达特异性,可能在澳洲坚果抗寒分子机制中发挥重要的调控作用。

关 键 词:澳洲坚果  蛋白磷酸酶  PP1  基因克隆  表达分析  低温胁迫
收稿时间:2021-01-30

Cloning and expression analysis of MiSTPP6 gene from Macadamia integrifolia under cold stress
CAI Yuan-bao,YANG Xiang-yan,LI Ji-dong,HUANG Si-jie,LI Mu,WU Fu-min.Cloning and expression analysis of MiSTPP6 gene from Macadamia integrifolia under cold stress[J].Journal of Southern Agriculture,2021,52(12):3205-3211.
Authors:CAI Yuan-bao  YANG Xiang-yan  LI Ji-dong  HUANG Si-jie  LI Mu  WU Fu-min
Institution:Guangxi Subtropical Crops Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530001, China
Abstract:
Keywords:
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