| 侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析 |
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| 引用本文： | 郑乾明,柏自琴,王小柯,林乾,王彬,马玉华.侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析[J].贵州农业科学,2022,50(4):1-7. |
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| 作者姓名： | 郑乾明 柏自琴 王小柯 林乾 王彬 马玉华 |
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| 作者单位： | 贵州省果树科学研究所 |
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| 基金项目： | 贵州省优秀青年科技人才培养计划项目“火龙果提质增效关键技术集成与示范”[黔科合平台人才(2019)5642]； |
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| 摘 要： | 【目的】分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒（Cactus virus X，CVX）及其NTU株系的基因组序列遗传变异, 为建立分子检测和防控体系奠定理论基础。【方法】对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析，分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化。【结果】获得4条CVX（CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS和CVX-ZYP）和5条CVX-NTU（CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP）贵州火龙果分离物近全长基因组序列，长度为6 494～6 603 bp，覆盖参考基因组96.2%～99.6%；CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3%～98.6%，与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1%～98.0%；CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1%～98.8%，与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6%～99.1%；系统进化分析表明，CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化。【结论】研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性，未发生明显遗传变异。
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| 关 键 词： | 仙人掌X病毒 宏转录组测序 遗传变异 序列一致性 |
Genome Sequence Isolation and Variation Analysis of Cactus virus X Infecting Hylocereus undatus in Guizhou |
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| ZHENG Qianming,BAI Ziqin,WANG Xiaoke,LIN Qian,WANG Bin,MA Yuhua.Genome Sequence Isolation and Variation Analysis of Cactus virus X Infecting Hylocereus undatus in Guizhou[J].Guizhou Agricultural Sciences,2022,50(4):1-7. |
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| Authors: | ZHENG Qianming BAI Ziqin WANG Xiaoke LIN Qian WANG Bin MA Yuhua |
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