| 利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因 |
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| 引用本文： | 李龙云,于霁雯,翟红红,黄双领,李兴丽,张红卫,张金发,喻树迅.利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因[J].作物学报,2011,37(1):95-104. |
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| 作者姓名： | 李龙云 于霁雯 翟红红 黄双领 李兴丽 张红卫 张金发 喻树迅 |
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| 作者单位： | 1 中国农业科学院棉花研究所，农业部棉花遗传改良重点实验室，河南安阳 455000；2 西北农林科技大学农学院，陕西杨凌712100；3 美国新墨西哥州立大学植物与环境科学部，美国新墨西哥州 80003 |
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| 基金项目： | 本研究由国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10A109, 2006AA100105)资助。 |
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| 摘 要： | 从回交近交系(backcross inbred lines, BIL)群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062 (33.03 mm)和 NMGA-140 (25.87 mm)，利用Affymetrix棉花基因芯片，分析其开花后10 d (DPA, days post anthesis)棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中，两材料间差异表达的转录本有7 282条，占总数的30.31%；其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3 993条，占筛选转录本总数的16.62%，功能分类表明这些转录本主要包括功能预测基因(15.57%)、翻译、核糖体结构相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换相关基因(9.29%)3大类。为了验证芯片数据的可信性，8个差异表达显著的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at, ACO1, ARF1, SAHH, TUA6, TUA7, β-tub1, β-tub10)被用于实时荧光定量PCR。两种检测手段表现出一致性。随后，利用实时荧光定量PCR对3个与棉纤维相关基因(ARF1, β-tub1, β-tub10)在纤维发育不同时期(5、10、15、20和25 DPA)的表达模式进行了研究，结果表明，3个基因在纤维伸长发育时期(10和15 DPA)大量表达，推测这3个基因可能与棉纤维伸长有重要关系。
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| 关 键 词： | 基因芯片 纤维伸长相关基因 差异表达基因 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2010-03-12 |
Identification of Fiber Length-Related Genes Using Cotton Oligonucleotide Microarrays |
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| LI Long-Yun,YU Ji-Wen,ZHAI Hong-Hong,HUANG Shuang-Ling,LI Xing-Li,ZHANG Hong-Wei,ZHANG Jin-Fa,YU Shu-Xun.Identification of Fiber Length-Related Genes Using Cotton Oligonucleotide Microarrays[J].Acta Agronomica Sinica,2011,37(1):95-104. |
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| Authors: | LI Long-Yun YU Ji-Wen ZHAI Hong-Hong HUANG Shuang-Ling LI Xing-Li ZHANG Hong-Wei ZHANG Jin-Fa YU Shu-Xun |
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| Institution: | 1.Cotton Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China;2.College of Agronomy, Northwest A&F University, Yangling 712100, China;3.Department of Plant and Enviromental Science, New Mexico State University, Las Cruces 80003, New Mexico, USA |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Affymetrix microarray Fiber length-related genes Differential expressed genes Quantitative RT-PCR |
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