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草鱼载脂蛋白A-I-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析
引用本文:刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰.草鱼载脂蛋白A-I-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析[J].大连水产学院学报,2012(1):12-17.
作者姓名:刘小献  白俊杰  于凌云  李胜杰
作者单位:[1]大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023 [2]中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(CARS-46-03);国家高技术研究发展计划项目(2011AA100403);国家科技支撑计划项目(2012BAD26B02)
摘    要:采用PCR产物直接测序法和PCR-RFLP法对草鱼EST文库中载脂蛋白A-I-1基因(Apoprotein A-I-1,apoA-I-1)3'非编码区进行SNPs筛选,在珠江水系草鱼Ctenopharyngodon idella养殖群体144个样本中发现2个SNPs位点。C792T位点的CC型占46.53%,CT型占50.69%,TT型占2.78%;G851A位点的GG型占77.08%,GA型占20.83%,AA型占2.08%。采用一般线性模型对2个SNPs位点与草鱼4个生长性状———体质量、体长、体高和头长进行关联分析,结果表明:C792T位点TT型个体的体质量、体长、体高和头长均值高于CT型和CC型个体的生长性状指标值,但未达到显著水平(P〉0.05);G851A位点GG型个体的体质量、体长、体高和头长均值高于GA型和AA型个体的生长性状指标值,且GG型个体的体长和头长均值与GA型和AA型个体均存在显著差异(P〈0.05)。将2个SNPs位点不同基因型组合成6种双倍型,关联分析结果表明,双倍型D3(TTC792T-GGG851A)个体的体质量均值最高,D6型(CCC792T-AAG851A)个体的体质量均值最低,且二者在体长、体高、头长均值间存在显著差异(P〈0.05)。推测C792T位点TT型为有利基因型;G851A位点GG型为有利基因型,AA型为不利基因型。本研究结果为草鱼分子辅助育种提供了候选标记,为加快草鱼育种进程奠定了基础。

关 键 词:草鱼  SNP  载脂蛋白A-I  apoA-I-1  生长性状  双倍型  关联分析
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