葡萄VlCKX4表达特性分析与转录调控预测 |
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引用本文: | 李旭飞,杨盛迪,李松琦,刘海楠,裴茂松,韦同路,郭大龙,余义和.葡萄VlCKX4表达特性分析与转录调控预测[J].中国农业科学,2023,56(1):144-155. |
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作者姓名: | 李旭飞 杨盛迪 李松琦 刘海楠 裴茂松 韦同路 郭大龙 余义和 |
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作者单位: | 河南科技大学园艺与植物保护学院/河南省园艺植物品质调控工程技术研究中心,河南洛阳 471023 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32072517);河南省高校科技创新人才支持计划(21HASTIT035);河南省高校科技创新团队支持计划(21IRTSTHN021);洛阳市科技发展计划(2101102A) |
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摘 要: | 【目的】通过克隆细胞分裂素脱氢酶/氧化酶基因VlCKX4及其启动子,进行表达特性分析和启动子活性分析并进行转录因子预测,为深入解析VlCKX4介导细胞分裂素信号途径调控葡萄坐果的分子机制提供依据。【方法】使用生物信息学方法分析‘巨峰’葡萄(Vitis vinifera×Vitis labrusca)细胞分裂素氧化酶/脱氢酶4(VlCKX4)的序列特征;利用PCR技术克隆该基因以及它的启动子,使用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)分析VlCKX4的表达特性,GUS活性试验用于分析其启动子活性;利用PlantTFDB、CisBP等转录调控数据库对VlCKX4的转录调控关系进行预测分析,输出结果使用Gephi软件进行可视化。【结果】VlCKX4全长1 582 bp,其中包含1 566 bp的开放阅读框,编码522个氨基酸,具有家族特征的FAD结构域和细胞分裂素结合(ck-binding)结构域。qRT-PCR结果表明VlCKX4在花序中高表达,其次是叶片,在卷须中表达量最低;细胞分裂素CPPU处理后VlCKX4表达量先下降后上升,细胞分...
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关 键 词: | ‘巨峰’葡萄 细胞分裂素 VlCKX4 启动子活性 调控 |
收稿时间: | 2022-03-19 |
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