| 基于转录组SNP构建油茶主要品种资源的分子身份证 |
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| 引用本文： | 林萍,王开良,姚小华,任华东.基于转录组SNP构建油茶主要品种资源的分子身份证[J].中国农业科学,2023,56(2):217-235. |
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| 作者姓名： | 林萍 王开良 姚小华 任华东 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所/浙江省林木育种技术研究重点实验室，杭州 311400 |
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| 基金项目： | 国家“十三五”科技基础资源调查专项(2019FY100801);浙江省林木新品种选育重大科技专项课题(2021C02070-2) |
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| 摘 要： | 【目的】近年来，油茶（Camellia oleifera）产业发展迅速，已成为中国四大油料之一。油茶良种不断涌现，但品质参差不齐，“同名异物、同物异名”等现象时有发生。建立油茶品种资源的单核苷酸多态性（single-nucleotide polymorphism,SNP）分子标记数据库，筛选重要SNP位点，开发油茶品种资源DNA指纹图谱，构建油茶品种资源的分子身份证，为品种鉴别、品种追溯等提供分子水平鉴别技术支撑。【方法】以221份普通油茶品种资源为材料，提取未成熟种子RNA，进行转录组测序。以二倍体南荣油茶基因组为参考，识别供试油茶品种资源的SNP位点并基因分型，利用SNP数据分析油茶群体及亚群的遗传多样性，分析SNP位点的观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量（PIC）等信息，筛选核心SNP位点并采用Sanger测序验证，得到最优SNP位点组合后，结合品种资源基本信息构建油茶品种资源分子身份证。【结果】从油茶转录组中共检测到1 849 953个高质量SNP位点。群体遗传多样性分析发现，油茶群体观测杂合度为0.2966，期望杂合度为0.2462，固定指数为-0.2048,PIC为0.2...
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| 关 键 词： | 普通油茶 品种鉴别 单核苷酸多态性 指纹图谱 分子身份证 |
| 收稿时间： | 2022-08-25 |
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