| 全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子 |
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| 引用本文： | 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,蔺经,常有宏.全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子[J].中国农业科学,2023,56(7):1377-1390. |
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| 作者姓名： | 李慧 张雨峰 李晓刚 王中华 蔺经 常有宏 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室;2. 南京林业大学生物与环境学院 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金(BK20191238); 江苏现代农业（梨）产业技术体系项目[ATS(2021); 国家自然科学基金面上项目(31772287) |
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| 摘 要： | 【目的】鉴定不同杜梨株系根中响应盐胁迫信号的相关转录因子，分析盐胁迫下基因序列DNA甲基化变化与基因表达改变之间的关系，探讨参与调控不同杜梨株系耐盐能力的转录因子成员。【方法】以杜梨耐盐株系和普通株系为试材，在苗期使用200 mmol·L-1 NaCl对90日龄组培生根苗进行水培处理，以Hoagland营养液为对照。利用火焰石墨炉原子吸收光谱仪测定钠离子含量；利用全基因组DNA甲基化和转录组测序技术从表观遗传修饰和转录调控水平对盐胁迫下转录因子进行生物信息学分析；最后用McrBC-PCR和qPCR对差异转录因子进行验证。【结果】外源NaCl处理24 h后，杜梨植株中钠离子含量显著增加，其中耐盐株系的增加幅度比普通株系小，为普通株系钠含量的73.1%，但根中积累的钠是普通株系含量的1.1倍；杜梨根中检测到69类共2 682个转录因子的表达，盐胁迫后243个转录因子在两个株系中都发生了差异表达，包括AP2/ERF(37个)、bHLH(19个)、bZIP(7个)、HD-Zip(10个)、MYB(30个)、NAC(18个)、WRKY(8个)和ZFP(23个)等家族成员；盐...
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| 关 键 词： | 杜梨 盐胁迫 转录因子 DNA甲基化 转录组 |
| 收稿时间： | 2022-05-05 |
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