杨树PsChiⅠ基因全长的克隆与表达分析 |
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引用本文: | 王 琼,曹支敏.杨树PsChiⅠ基因全长的克隆与表达分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2014,42(7):83-88,94. |
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作者姓名: | 王 琼 曹支敏 |
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作者单位: | 西北农林科技大学 林学院;西北农林科技大学 林学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30872027) |
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摘 要: | 【目的】克隆川杨几丁质酶基因cDNA全长序列,分析其在病原菌侵染过程中不同时段的表达特征。【方法】以受落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina)单孢子堆菌系Sb052侵染后的川杨叶片为试材,采用RACE法克隆川杨几丁质酶基因cDNA序列,对其进行生物信息学和实时荧光定量表达分析。【结果】克隆到1条川杨几丁质酶基因序列,将其命名为PsChiⅠ(GenBank登录号:KC416180)。该序列全长1 145bp,包含1段960bp的开放阅读框(ORF),38bp的5′非编码区和147bp的3′非编码区。其编码蛋白含有319个氨基酸,具有2条糖苷水解酶19家族特征序列,理论等电点为5.03,为ClassⅠb型酸性几丁质酶,属于几丁质酶第19家族。序列比对和系统进化树结果表明,PsChiⅠ与毛果杨(Populus trichocarpa)几丁质酶基因相似性最高,且亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果表明,菌系Sb052侵染杨树叶片后PsChiⅠ基因在各个时段都有表达,但以侵染后12和48h时的表达量相对较高。【结论】获得了几丁质酶基因全长序列,推测其参与了寄主川杨抵抗真菌的防御机制。
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关 键 词: | 杨树 几丁质酶基因 RACE技术 实时荧光定量PCR |
收稿时间: | 2013/5/10 0:00:00 |
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