| 牛优势卵泡膜细胞黄体化相关基因的筛选 |
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| 引用本文： | 孟金柱,伍春亚,潘春威,等.牛优势卵泡膜细胞黄体化相关基因的筛选[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2022,50(3):1-9. |
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| 作者姓名： | 孟金柱 伍春亚 潘春威 等 |
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| 作者单位： | 铜仁学院 贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,湖南农业大学 动物医学院 |
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| 基金项目： | 贵州省科技计划项目（黔科合基础［2020］1Y138）；铜仁市科技计划项目（铜市科研［2020］80号）；贵州省重点实验室项目（黔科合平台人才［2020］2003号）；铜仁市科技局科技支撑计划项目（铜市科研［2020］128号）；铜仁学院生态畜牧创新团队项目（CXTD［2020-19］） |
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| 摘 要： | 【目的】探究牛卵巢小黄体细胞（SLCs）和膜细胞（TCs）中的差异表达基因，进而筛选与TCs黄体化密切相关的基因，为深入研究SLCs、TCs特异性及TCs向SLCs分化的机制提供参考。【方法】利用R软件limma包中的DESeq2，筛选GEO芯片数据库GSE83524数据集TCs和SLCs中的差异表达基因，再用goseq软件对筛选出的差异表达基因进行GO功能富集分析，用 kobas软件进行KEGG信号通路分析，使用String结合Cytoscape软件进行PPI网络互作分析。采集思南黄牛颗粒细胞(GCs)和TCs，以RPLP0作为内参基因，用荧光定量 PCR法对筛选出的与TCs增殖及黄体化相关的基因进行验证。【结果】共筛选获得237个差异表达基因，其中表达上调的基因115个，表达下调的基因122个。GO功能分析结果显示，参与生物学过程的有147个基因，占差异表达基因总数的53.6%，分别富集于30个组；参与细胞组分的有125个基因，占差异表达基因总数的21.4%，分别富集于12个组；参与分子功能的有98个基因，占差异表达基因总数的25.0%，分别富集于14个组。KEGG分析共发现17条通路，其中可能与卵泡内膜细胞黄体化相关的通路为FSHR、PLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1等4个基因参与的卵巢类固醇生成通路。经过PPI网络互作分析，筛选出了前10位的hub基因。荧光定量 PCR分析结果显示，FSHR、PLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1、BUB1B和KIF20A在SLCs和TCs中的转录水平与GEO芯片数据结果一致，表现为FSHR、CYP19A1和CYP17A1在TCs中的表达量极显著高于其在SLCs中的表达量(P<0.01)，PLA2G4A、BUB1B和KIF20A在TCs中的表达量亦显著高于其在SLCs中的表达量 (P<0.05)。【结论】差异表达基因FSHR、PLA2G4A、CYP19A1、CYP17A1、BUB1B和KIF20A在牛优势卵泡TCs增殖分化形成黄体的过程中发挥关键作用。
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| 关 键 词： | 牛 差异表达基因 膜细胞 小黄体细胞 黄体化 |
| 收稿时间： | 2021/4/6 0:00:00 |
Screening of genes related to luteinization in dominant follicular theca cells of cattle |
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| MENG Jinzhu,WU Chuny,PAN Chunwei,et al.Screening of genes related to luteinization in dominant follicular theca cells of cattle[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2022,50(3):1-9. |
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| Authors: | MENG Jinzhu WU Chuny PAN Chunwei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cattle differentially expressed genes theca cells small luteum cells luteinization |
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