| 1株麻雀源坦布苏病毒的分离鉴定及全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 刘鑫,刁有祥,陈浩,王蛟,孙晓艳,葛平萍,郝东敏.1株麻雀源坦布苏病毒的分离鉴定及全基因组序列分析[J].中国兽医学报,2015(2):201-206. |
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| 作者姓名： | 刘鑫 刁有祥 陈浩 王蛟 孙晓艳 葛平萍 郝东敏 |
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| 作者单位： | 山东农业大学动物科技学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31272583);国家水禽产业技术体系资助项目(CARS-43-34);现代农业产业技术体系建设专项基金资助项目(NYCYTX-45-11) |
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| 摘 要： | 从山东地区某发病鸭场周围的麻雀体内分离到1株坦布苏病毒,命名为SDS株,并对分离毒株进行毒力测定。应用RT-PCR技术对分离株全基因组进行扩增并测序,将获得的SDS株坦布苏病毒全基因组序列与已在Gen Bank发表的24株坦布苏病毒和6株其他黄病毒属病毒全基因组序列进行遗传进化分析。结果表明,该株坦布苏病毒的基因组全长为10 990 nt,包含94 nt的5'端非编码区、618 nt的3'端非编码区和一个开放阅读框(3 425个氨基酸),编码11种病毒蛋白;与Gen Bank已发表的坦布苏病毒的核苷酸序列同源性为98.2%~99.5%,氨基酸序列同源性为98.1%~99.4%,其中与鸭源WFZ株(KC990545.1)的核苷酸序列同源性最高为99.5%,与鹅源坦布苏病毒(duck eggdrop syndrome virus strain goose,JQ920424.1)和鸡源坦布苏病毒(CJD50,JF926699)的核苷酸序列同源性较低为98.9%。用Net NGlyc 1.0 Server在线软件对病毒蛋白潜在糖基化位点进行预测,结果表明在SDS株病毒多聚蛋白中共有13个潜在的糖基化位点,分别位于5个不同病毒蛋白中。
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| 关 键 词： | 坦布苏病毒 分离鉴定 全基因 序列分析 |
Identification and complete genomic sequence analysis of a Tembusu virus isolated from sparrows |
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| LIU Xin;DIAO You-xiang;CHEN Hao;WANG Jiao;SUN Xiao-yan;GE Ping-ping;HAO Dong-min.Identification and complete genomic sequence analysis of a Tembusu virus isolated from sparrows[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2015(2):201-206. |
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| Authors: | LIU Xin;DIAO You-xiang;CHEN Hao;WANG Jiao;SUN Xiao-yan;GE Ping-ping;HAO Dong-min |
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| Institution: | LIU Xin;DIAO You-xiang;CHEN Hao;WANG Jiao;SUN Xiao-yan;GE Ping-ping;HAO Dong-min;College of Animal Science and Technology,Shandong Agricultural University; |
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