| 贝氏隐孢子虫Rhomboid基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 薛雪,阳毅敏,陈学秋,杜爱芳.贝氏隐孢子虫Rhomboid基因的克隆与生物信息学分析[J].中国兽医学报,2015(2):235-241. |
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| 作者姓名： | 薛雪 阳毅敏 陈学秋 杜爱芳 |
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| 作者单位： | 浙江大学动物科学学院 |
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| 基金项目： | 浙江省重大科技专项重点农业资助项目(2012C12009-2) |
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| 摘 要： | 将Gen Bank中发表的C.parvum、C.hominis和C.muris的菱形体蛋白(Rhomboid,ROM)基因序列进行比对分析,设计合成该基因保守片段的1对特异性引物,以贝氏隐孢子虫基因组DNA为模板,PCR扩增出CbROM基因保守片段,采用染色体步移技术获得基因片段3'端和5'端核苷酸序列,并对所得序列进行测序、拼接与生物信息学分析。结果显示,CbROM基因ORF长度为1 422 bp,编码473个氨基酸,蛋白质理论相对分子质量为52 700,等电点为8.65,是疏水性蛋白质,含有7个串连的跨膜螺旋区,无信号肽;该基因含有典型的菱形体蛋白相关保守结构域,属于菱形体蛋白酶家族;功能位点分析结果显示,CbROM蛋白序列包含6个N-糖基化位点,2个c AMP、c GMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,8个蛋白激酶C磷酸化位点,7个酪蛋白激酶II磷酸化位点和10个N-豆蔻酰化位点;二级结构中包含α-螺旋38.27%,β-折叠16.7%和无规则卷曲45.03%。本试验获得的贝氏隐孢子虫的Rhomboid基因序列,为该基因功能的进一步研究及其基因工程疫苗的研制奠定基础。
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| 关 键 词： | 贝氏隐孢子虫 Rhomboid基因 染色体步移 生物信息学分析 |
Molecular cloning and bioinformatics analysis of Rhomboid gene in Cryptosporidium baileyi |
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| XUE Xue;YANG Yi-min;CHEN Xue-qiu;DU Ai-fang.Molecular cloning and bioinformatics analysis of Rhomboid gene in Cryptosporidium baileyi[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2015(2):235-241. |
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| Authors: | XUE Xue;YANG Yi-min;CHEN Xue-qiu;DU Ai-fang |
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| Institution: | XUE Xue;YANG Yi-min;CHEN Xue-qiu;DU Ai-fang;College of Animal Sciences,Zhejiang University; |
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