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橡胶树sHSP基因家族的表达谱分析
引用本文:纪向云,印汉,任小青,李德军,夏志辉.橡胶树sHSP基因家族的表达谱分析[J].热带作物学报,2021,42(12):3424-3432.
作者姓名:纪向云  印汉  任小青  李德军  夏志辉
作者单位:1.海南大学热带作物学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海南海口 5702282.中国热带农业科学院橡胶研究所,海南海口 571101
基金项目:国家自然科学基金项目(31860196)
摘    要:小热激蛋白(small heat shock protein, sHSP)是一类胁迫诱导蛋白,不仅参与植物发育还响应生物与非生物胁迫。本研究通过分析转录组数据获得橡胶树12个sHSP基因家族成员。生物信息学分析和表达谱分析结果表明:蛋白保守结构预测显示12个sHSP均具有α-晶体蛋白保守结构域;二级结构预测结果显示,12个sHSP均由α-螺旋、β-转角、延伸链和大量的随机卷曲组成。通过RT-PCR技术分析,结果发现这12个sHSP家族基因在橡胶树不同组织和叶片不同发育时期中表达有明显差异,HbsHSP15.8HbsHSP16.2HbsHSP17.3HbsHSP17.4HbsHSP17.5bHbsHSP18.2HbsHSP18.3HbsHSP22.5HbsHSP22.6HbsHSP23.9在胶乳中高表达,HbsHSP17.4在树皮中高表达,HbsHSP17.5a在树茎中高表达,HbsHSP25.8则在树叶中表达量最高。乙烯利处理后,12个sHSP家族基因的表达总体呈下降趋势。在不同死皮等级橡胶树中12个sHSP家族基因的表达也具有明显差异,与健康树相比,HbsHSP15.8HbsHSP17.4HbsHSP17.5aHbsHSP17.5bHbsHSP18.2HbsHSP18.3HbsHSP22.6HbsHSP23.9HbsHSP25.8在死皮树中的表达量呈下降趋势;HbsHSP16.2HbsHSP17.3HbsHSP22.5的表达量呈上升趋势。因此推测橡胶树sHSP家族基因可能参与橡胶树生物与非生物逆境胁迫响应,以及可能在乙烯作用途径中发挥作用。

关 键 词:橡胶树  小热激蛋白  表达谱分析  胁迫响应  
收稿时间:2021-04-02

Expression Profiles Analysis of sHSPs in Hevea brasiliensis
JI Xiangyun,YIN Han,REN Xiaoqing,LI Dejun,XIA Zhihui.Expression Profiles Analysis of sHSPs in Hevea brasiliensis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2021,42(12):3424-3432.
Authors:JI Xiangyun  YIN Han  REN Xiaoqing  LI Dejun  XIA Zhihui
Institution:1. College of Tropical Crops, Hainan University / Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bioresources, Haikou, Hainan 570228, China2. Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China
Abstract:
Keywords:Hevea brasiliensis   small heat shock protein  expression profiles analysis  stress response  
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