| 基于转录组的非洲菊PLC基因家族鉴定与进化分析 |
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| 引用本文： | 王秀美,倪珊珊,李乾玉,李小芳,林争春,陈裕坤,林玉玲,赖钟雄,杜迎刚.基于转录组的非洲菊PLC基因家族鉴定与进化分析[J].热带作物学报,2021,42(5):1267-1273. |
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| 作者姓名： | 王秀美 倪珊珊 李乾玉 李小芳 林争春 陈裕坤 林玉玲 赖钟雄 杜迎刚 |
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| 作者单位： | 1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 3500022.潍坊科技学院山东省高校设施园艺实验室,山东寿光 262700 |
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| 基金项目： | 福建省重大农业科技专项(2015NZ0002-1);福建农林大学科技创新基金(CXZX2017189);潍坊科技学院三大平台科研项目(2018YY010) |
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| 摘 要： | 磷脂酶C（phospholipase C,PLC）广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用。本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个。非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~594 aa之间,蛋白理论分子量为11 410.25~67 998.85 kDa,等电点为4.74~9.59,均为不稳定亲水蛋白。亚细胞定位预测结果显示,13个成员分别定位于细胞壁、细胞膜、细胞质、叶绿体和细胞核中,表明不同成员功能上可能存在多样性。进化树分析表明,13个非洲菊PLC蛋白可分为2个亚组,进化关系较近的蛋白结构组成相似。非洲菊PLC家族成员在拟南芥中的同源蛋白PLC2、PLC4、AT2G40116可相互作用。非洲菊转录组的FPKM值分析表明,GjPLC2、GjPLC3、GjPLC8、GjPLC10在非洲菊中表达量高,感病植株中变化大,可能在抵御真菌感染过程中发挥重要作用。研究结果可为进一步研究非洲菊PLC基因的生物学功能提供依据。
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| 关 键 词： | 非洲菊 磷脂酶C 基因家族 进化分析 |
| 收稿时间： | 2020-06-11 |
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