绵羊IGFBP-5基因的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 周明亮,杨平贵,吴登俊,张翔宇.绵羊IGFBP-5基因的克隆及序列分析[J].黑龙江畜牧兽医,2015(3):14-17,21,235-236. |
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作者姓名: | 周明亮 杨平贵 吴登俊 张翔宇 |
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作者单位: | 四川省草原科学研究院;四川农业大学动物科技学院;四川省畜牧科学研究院 |
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基金项目: | 农业部公益性行业科研专项(201003061);四川省畜禽育种攻关项目(01NG029-18) |
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摘 要: | 为了克隆IGFBP-5基因的CDS序列及其生物信息学分析,试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-5基因的CDS全序列,并用生物信息学方法深入分析其序列。结果表明:IGFBP-5基因的CDS序列为816 bp,编码271个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为97%、94%、89%,氨基酸序列同源性分别为98%、98%、95%,Gen Bank登录号为EU727460.1;IGFBP-5基因的氨基酸分子质量为30.3 ku,理论等电点(p I)为8.56;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与蟾、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-5基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、22个磷酸化位点、2个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为66.42%、22.51%、11.07%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。
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关 键 词: | IGFBP-5 克隆 基因 绵羊 蛋白质 序列 |
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