| 荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建 |
| |
| 引用本文： | 董凤英,王家保,徐碧玉,金志强.荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建[J].热带作物学报,2009,30(5):677-682. |
| |
| 作者姓名： | 董凤英 王家保 徐碧玉 金志强 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点实验室,海口,571101;海南大学农学院,海口,570228
2. 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点实验室,海口,571101 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，海南省教育厅高等学校科研项目，中央级公益性科研院所基本科研业务专项基金 |
| |
| 摘 要： | 根据荔枝果皮cDNA微阵列信号分析结果,对荔枝cDNA文库的BA05-H4克隆测序.NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)ORF分析发现其含有1个完整的开放读码框.编码152个氨基酸残基的多肽,为一全长cDNA序列.Blastx比对分析表明该基因编码的蛋白与其它植物来源的ASR(abscisic acid,stress and ripening indueible)蛋白高度同源,该基因被命名为LcAsr,通过PCR的方法获得其DNA全长序列.生物信息学分析结果表明,LcAsr基因的DNA序列全长为1 177 bp,读码框中间包含1个488 bp的内含子.Protparam预测分析结果表明LcAsr基因编码蛋白的分子式为C756H1130N228O238S1,相对分子质量为17 252.7,等电点pI6.10,富含Glu、His、Lys、Ala.Predict protein预测该蛋白的二级结构主要是α螺旋.有1个酪氨酸激酶磷酸化位点、2个酪蛋白激酶II磷酸盐化位点、3个豆蔻酰化位点等,并具有很高的亲水性,预测该蛋白位于细胞核.构建了植物荧光表达载体pCAMBIA-LcAsr,并通过基因枪转化法转化洋葱表皮细胞进行瞬时表达,对LcASR蛋白进行亚细胞定位,结果表明LcASR蛋白定位于细胞核.
|
| 关 键 词： | 荔枝 LcAsr基因 生物信息学分析 载体构建 亚细胞定位 |
Bioinformatic Analysis and Construction of Plant Expression Vector of LcAsr Gene from Litchi |
| |
| Dong Fengying,Wang Jiabao,Xu Biyu and Jin Zhiqiang.Bioinformatic Analysis and Construction of Plant Expression Vector of LcAsr Gene from Litchi[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2009,30(5):677-682. |
| |
| Authors: | Dong Fengying Wang Jiabao Xu Biyu and Jin Zhiqiang |
| |
| Institution: | Dong Fengying1.2,Wang Jiabao1,Xu Biyu1,Jin Zhiqiang1 1 Ministry of Agriculture Key Biotechnology Laboratory for Tropical Crops/ Institute of Tropical Bioscience , Biotechnology,CATAS,Haikou 571101,2 College of Agronomy,Hainan University,Haikou 570228 |
| |
| Abstract: | The BAO5-H4 from Litchi cDNA library was sequenced based on the results of cDNA microarry, and a full-length cDNA was obtained and designated as LcAsr. Sequence analysis shows that the cDNA of LcAsr is 799 bp, containing an open reading frame encoding 152 amino acids. The encoding protein is homologous with the ASR (abscises acid, stress and ripening inducible) protein from other plants. The DNA sequence of the LcAsr was obtained by using PCR method. Sequence analysis shows the full-length LcAsr DNA is 1 17... |
| |
| Keywords: | Litchi LcAsr gene bioinformatics analysis vector construct subculture localization |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《热带作物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《热带作物学报》下载免费的PDF全文 |
|
