| 棉花盐胁迫下叶片miRNAs的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 许菲菲,彭振,龚文芳,何守朴,庞保印,杜雄明.棉花盐胁迫下叶片miRNAs的鉴定与分析[J].棉花学报,2014,26(5):377-386. |
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| 作者姓名： | 许菲菲 彭振 龚文芳 何守朴 庞保印 杜雄明 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳,455000 |
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| 基金项目： | “十二五”国家科技支撑计划“经济作物种质资源发掘与创新利用”，973项目“棉花品质产量基因资源创制” |
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| 摘 要： | microRNAs(miRNAs)是一类21~24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA,small RNA),通过介导目标mRNA的切割或者抑制翻译来调节植物基因的表达。本文利用200 mmol·L-1NaCl分别处理3叶期耐盐品系早熟长绒7号和盐敏感品系南丹巴地大花4 h,构建了4个小RNA文库并测序。以雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)D5基因组和本实验室陆地棉(Gossypium hirsutum L.)盐胁迫转录组测序拼接得到的序列作为参考,共发现360个miRNA,包括308个保守的miRNA和52个可信度高的新miRNA。2个品系共出现94个差异表达的miRNA,表达模式可分为2大类,筛选出20个候选miRNA。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析表明,耐盐品系显著富集的信号通路是抗原加工过程,而盐敏感品系显著富集的是生物碱合成途径。
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| 关 键 词： | 盐胁迫 miRNA 小RNA测序 靶基因预测 |
| 收稿时间： | 2014-01-21 |
Identification and Analysis of miRNAs in Cotton Leaves under Salt Stress |
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| Xu Feifei,Peng Zhen,Gong Wenfang,He Shoupu,Pang Baoyin,Du Xiongming.Identification and Analysis of miRNAs in Cotton Leaves under Salt Stress[J].Cotton Science,2014,26(5):377-386. |
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| Authors: | Xu Feifei Peng Zhen Gong Wenfang He Shoupu Pang Baoyin Du Xiongming |
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| Institution: | Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology, Anyang, Henan 455000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | salt stress miRNAs sRNA sequencing prediction of target genes |
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