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高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析
引用本文:庞强强,李植良,罗少波,陈日远,金庆敏,黎振兴,李德明,孙保娟,孙光闻.高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析[J].园艺学报,2017,44(3):475-486.
作者姓名:庞强强  李植良  罗少波  陈日远  金庆敏  黎振兴  李德明  孙保娟  孙光闻
作者单位:广东省农业科学院蔬菜研究所,广州 510640;华南农业大学园艺学院,广州 510642;海南省农业科学院蔬菜研究所,海口 570100
基金项目:国家自然科学基金项目(31501755),广东省自然科学基金项目(2015A030313568),广东省科技计划项目(2016B070701010),广州市科技计划项目(2014J4100094
摘    要:为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。

关 键 词:茄子  高温胁迫  内参基因  表达稳定性  实时荧光定量PCR

Selection and Stability Analysis of Reference Gene for qRT-PCR in Eggplant Under High Temperature Stress
PANG Qiangqiang,,LI Zhiliang,LUO Shaobo,CHEN Riyuan,JIN Qingmin,LI Zhenxing,LI Deming,SUN Baojuan,SUN Guangwen,.Selection and Stability Analysis of Reference Gene for qRT-PCR in Eggplant Under High Temperature Stress[J].Acta Horticulturae Sinica,2017,44(3):475-486.
Authors:PANG Qiangqiang      LI Zhiliang  LUO Shaobo  CHEN Riyuan  JIN Qingmin  LI Zhenxing  LI Deming  SUN Baojuan    SUN Guangwen  
Institution:Vegetable Research Institute,Guangdong Academy of Agricultural Sciences,Guangzhou 510640,China;Horticultural College,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China;Vegetable Research Institute,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou 570100,China
Abstract:
Keywords:Solanum melongena  high temperature stress  reference gene  expression stability  real-time fluorescence quantitative PCR
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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