| 猪圆环病毒II 型 rep蛋白的亚细胞定位生物信息学析 |
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| 引用本文： | 王印,李昕然,姜雪梅,徐志文.猪圆环病毒II 型 rep蛋白的亚细胞定位生物信息学析[J].西南农业学报,2009,22(4). |
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| 作者姓名： | 王印 李昕然 姜雪梅 徐志文 |
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| 作者单位： | 四川农业大学,动物医学院,四川,雅安,625014 |
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| 摘 要： | 从GenBank 发表的PCV-2全基因组序列,随机选择其中的32 个全基因序列,做序列比对和同源性比较,绘制系统进化树,在注释中找到ORF1编码的rep蛋白氨基酸序列, 用在线生物信息学工具对其进行亚细胞定位分析.结果基本符合"来自同一地区的基因序列同源性较高"的规律,表明了PCV的高度保守性, 亚细胞定位分析发现其rep蛋白定位于核区的指数为0.76,这与病毒在宿主细胞核内复制分不开.结果同时表明其定位于过氧化物酶体的指数显著不同于其他(过氧化物酶体平均0.36,可变,溶酶体、线粒体均为0.1不变)这可能与pcv的组织嗜性以及复制靶细胞(多为单核/巨噬细胞)的原因相关.
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| 关 键 词： | rep蛋白 生物信息学 亚细胞定位 |
Bioinformatic Analysis of Subcellular Localization Prediction of Rep Protein of PCV-2 |
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| WANG Yin,LI Xin-ran,JIANG Xue-mei,XU Zhi-wen.Bioinformatic Analysis of Subcellular Localization Prediction of Rep Protein of PCV-2[J].Southwest China Journal of Agricultural Sciences,2009,22(4). |
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| Authors: | WANG Yin LI Xin-ran JIANG Xue-mei XU Zhi-wen |
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| Keywords: | PCV-II |
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