| 甜菜小G蛋白BvRab基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 付荻,刘赫,于冰,李海英.甜菜小G蛋白BvRab基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析[J].中国糖料,2024(1):1-12. |
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| 作者姓名： | 付荻 刘赫 于冰 李海英 |
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| 作者单位： | 黑龙江大学生命科学学院/农业微生物技术教育部工程研究中心/黑龙江省寒区植物基因与生物发酵重点实验室/黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然基金面上项目“转录因子BvGT-1调控乙二醛酶Ⅰ基因参与甜菜单体附加系耐盐的分子机制”(32072122)资助； |
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| 摘 要： | 【目的】在全基因组范围内鉴定甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员，为研究甜菜小G蛋白BvRab基因家族功能奠定基础。【方法】本研究利用生物信息学手段对甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员进行筛选鉴定并进行理化性质、基因结构、蛋白保守基序、系统进化、染色体定位及共线性、启动子顺式作用元件和蛋白质互作预测分析。【结果】共鉴定到58个甜菜小G蛋白BvRab基因家族成员。同一类型中的不同基因具有较为一致的外显子和内含子结构，家族成员共有5个蛋白保守基序；甜菜小G蛋白BvRab基因家族包含8个亚家族；家族成员不均匀地分布在甜菜的9条染色体上；BvRab基因家族成员与番茄、拟南芥中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较近，与水稻中的小G蛋白Rab基因家族亲缘关系较远；BvRab基因家族成员启动子中含有多个激素应答元件和逆境应答元件；BvRab蛋白与参与植物生长发育及逆境应答相关的多种转录因子相互作用。【结论】本研究鉴定出58个BvRab基因家族成员，该基因家族成员可能在植物生长发育及逆境应答方面发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 甜菜 小G蛋白 Rab基因家族 生物信息学分析 |
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