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茶树TLP基因家族的全基因组鉴定及表达分析
引用本文:董旋,曹瑞,陆莹霞,杨军成.茶树TLP基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2023(11):3534-3543.
作者姓名:董旋  曹瑞  陆莹霞  杨军成
作者单位:贵州大学茶学院,山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室
基金项目:贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y001号);
摘    要:植物类甜蛋白(thaumatin-like protein, TLP)不止能参与宿主的多种发育进程还参与了胁迫反应。目前TLP已经在多种物种中被发现,但是对茶树中TLP家族基因的研究较少。本研究基于茶树基因组数据库筛选鉴定出43个茶树类甜蛋白基因,分别命名为CsTLP1~CsTLP43,对其基因结构、进化关系、染色体分布等进行分析,并基于其转录组数据进行了不同组织、PEG诱导的干旱胁迫和盐胁迫下的表达模式分析。结果表明:43个茶树TLP基因分别定位在11条染色体,其中14号染色体分布最多,包括8条基因家族成员,各染色体上基因分布不均;CsTLP的氨基酸数量为208~429 aa,分子量是22.33~46.41 kD,理论等电点(pl)为3.66~9.08,亲水性(GRAVY)介于-0.328~0.241,不稳定指数(Instability index)为19.65~59.93;基于TPIA中的转录组数据进行表达模式分析,分析结果显示,CsTLP基因在茎和嫩芽组织中表达水平较高;茶树在干旱胁迫、盐胁迫处理下不同的CsTLP基因存在差异表达,部分基因表达量上升明显,该结果说明在茶树生长发育...

关 键 词:茶树  TLP基因家族  基因组鉴定  基因表达分析
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