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野生二粒小麦YABBY转录因子家族的鉴定与表达分析
引用本文:高英,杨光,张瑞浦,潘文秋,聂小军.野生二粒小麦YABBY转录因子家族的鉴定与表达分析[J].分子植物育种,2023(1):17-26.
作者姓名:高英  杨光  张瑞浦  潘文秋  聂小军
作者单位:1. 西北农林科技大学农学院;2. 西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室
摘    要:YABBY基因是植物所特有的一类转录因子家族,在植物器官形成、生长发育、信号转导以及胁迫响应等生物学过程发挥着重要调控作用。野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)作为普通小麦的四倍体祖先种,一直是小麦遗传改良的重要种质和基因库,但目前有关野生二粒小麦的YABBY基因还未见报道。为了挖掘野生二粒小麦的YABBY基因,本研究利用生物信息学方法对野生二粒小麦YABBY转录因子家族进行了全基因组鉴定和分析,结果在野生二粒小麦基因组中共鉴定到了12个YABBY基因,归属于6个同源基因对且位于5个同源染色体组上。系统进化分析将它们分成YAB1/3、YAB5和CRC 3个亚家族,而且同一亚家族成员间具有相似的结构特征。基于RNA-seq数据的表达特性分析发现,YABBY在野生二粒小麦不同组织中具有特异性表达;同时,还鉴定发现了3个YAB5亚族成员在盐胁迫下发生了差异表达,进一步的qPCR分析验证了它们的表达特性,表明它们可能是盐胁迫响应相关的YABBY转录因子。

关 键 词:转录因子  野生二粒小麦  YABBY家族  表达模式
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