| 胡椒CPK基因家族鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 伍宝朵,李靖,胡丽松,范睿,杨建峰,郝朝运,闫林.胡椒CPK基因家族鉴定与表达分析[J].分子植物育种,2023(24):8046-8054. |
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| 作者姓名： | 伍宝朵 李靖 胡丽松 范睿 杨建峰 郝朝运 闫林 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院香料饮料研究所,海南省Sim Soonliang院士工作站,农业农村部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室,海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金项目(320QN346)；;国家现代农业产业技术体系项目(CARS-11)； |
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| 摘 要： | 钙依赖蛋白激酶(CPK)可作为Ca2+的感受器和效应器，在结合Ca2+后通过解除自抑制而激活自身激酶活性，并通过磷酸化靶蛋白实现信号转导。为了筛选鉴定胡椒CPK基因家族，探讨其基因进化及表达模式，本研究依据已公布胡椒基因组信息，利用生物信息学方法对胡椒CPK基因家族进行鉴定，共鉴定获得30个CPK基因，命名为PnCPK1～PnCPK30，并对该家族基因进行染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序、基因复制事件和表达分析。结果显示，大多数PnCPK基因含有6～8个内含子，30个PnCPK基因不均等地分布在18条染色体上，共有21对复制基因对，串联重复仅2对，Ka/Ks结果说明，胡椒CPK基因家族在进化选择中主要受纯化选择影响；为进一步分析胡椒和其他植物的同源进化关系，构建了胡椒与拟南芥、水稻的CPK进化树，胡椒CPK家族可分为4个亚族，GroupⅡ和GroupⅢ较保守；基于转录组数据结果显示，PnCPK家族各成员表达差异较明显，多数PnCPK成员在各组织中表达量差异不大，荧光定量PCR结果推测PnCPK4、PnCPK10和PnCPK16可能参与...
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| 关 键 词： | 胡椒 CPK基因家族 进化分析 低温胁迫 基因表达 |
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