马铃薯块茎创伤木栓化过程的转录组分析 |
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引用本文: | 马露,田登,李俊,杨芳,郭华春.马铃薯块茎创伤木栓化过程的转录组分析[J].分子植物育种,2023(4):1053-1064. |
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作者姓名: | 马露 田登 李俊 杨芳 郭华春 |
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作者单位: | 云南农业大学农学与生物技术学院 |
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摘 要: | 马铃薯块茎受到创伤后诱发的木栓化,对块茎的愈伤和保持良好品质等方面具有重要作用。为探究马铃薯块茎创伤木栓化过程中的分子机制,本研究以‘D47’为实验材料,在马铃薯块茎创伤后0、27、54 h分别取样进行转录组测序及分析。结果表明,创伤27 h后诱导的DEGs有8 184个,其中显著上调4 829个,显著下调3 355个;与27 h相比,54 h有3 385个DEGs,其中显著上调2 259个,显著下调1 126个。GO富集分析表明,差异基因主要集中在氧化还原酶活性、氧化还原过程、生物过程、代谢过程和催化活性。KEGG富集分析表明差异表达基因主要富集在苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、植物激素信号转导、脂肪酸代谢途径。实时荧光定量PCR验证结果表明,6个DEGs的差异表达结果与转录组分析的结果基本一致,证明转录组数据的可靠性。
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关 键 词: | 马铃薯 创伤木栓化 转录组分析 差异表达基因 |
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