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马铃薯块茎创伤木栓化过程的转录组分析
引用本文:马露,田登,李俊,杨芳,郭华春.马铃薯块茎创伤木栓化过程的转录组分析[J].分子植物育种,2023(4):1053-1064.
作者姓名:马露  田登  李俊  杨芳  郭华春
作者单位:云南农业大学农学与生物技术学院
摘    要:马铃薯块茎受到创伤后诱发的木栓化,对块茎的愈伤和保持良好品质等方面具有重要作用。为探究马铃薯块茎创伤木栓化过程中的分子机制,本研究以‘D47’为实验材料,在马铃薯块茎创伤后0、27、54 h分别取样进行转录组测序及分析。结果表明,创伤27 h后诱导的DEGs有8 184个,其中显著上调4 829个,显著下调3 355个;与27 h相比,54 h有3 385个DEGs,其中显著上调2 259个,显著下调1 126个。GO富集分析表明,差异基因主要集中在氧化还原酶活性、氧化还原过程、生物过程、代谢过程和催化活性。KEGG富集分析表明差异表达基因主要富集在苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、植物激素信号转导、脂肪酸代谢途径。实时荧光定量PCR验证结果表明,6个DEGs的差异表达结果与转录组分析的结果基本一致,证明转录组数据的可靠性。

关 键 词:马铃薯  创伤木栓化  转录组分析  差异表达基因
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