| 基于转录组的荔枝PAL基因家族鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 廖海达,江帆,何心蕊,字楠华,莫亦铭,陈萍.基于转录组的荔枝PAL基因家族鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2023(24):8036-8045. |
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| 作者姓名： | 廖海达 江帆 何心蕊 字楠华 莫亦铭 陈萍 |
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| 作者单位： | 1. 海南大学园艺学院;2. 海南大学三亚南繁研究院 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金项目(320RC491)资助； |
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| 摘 要： | 本研究通过运用荔枝采后褐变的转录组数据，运用生物信息学的方法对荔枝PAL基因家族进行鉴定，然后分析其理化性质、蛋白的各级结构、保守基序、与其他物种的进化关系及荔枝采后室温下褐变的基因表达模式。结果表明，共在荔枝中鉴定出4个具有PLN02457结构域的PAL基因。其蛋白质的长度为706～724个氨基酸，分子质量在39.990～43.759 kD，理论等电点存在于6.03～6.34之间，不稳定系数介于29.61～38.10，脂肪指数在88.87～93.40。各蛋白的α-螺旋介于54.72%～59.35%，无规则卷曲在30%左右，两者在二级结构中占比相对较高。4个荔枝PAL基因蛋白均存在MIO保守结构域，该结构域普遍存在于PAL基因家族蛋白中。4个荔枝PAL基因蛋白均存在PAL基因家族蛋白普遍出现的MIO保守结构域。通过多物种进化树分析发现荔枝与双子叶植物PAL基因家族的亲缘关系是相对较近的。4个荔枝PAL基因在室温下采后荔枝果皮发生褐变的过程中都展现了不同的表达模式。本研究发现了LcPAL2和LcPAL3 2个基因和PAL活性与荔枝果皮褐变有着很密切的联系，为进一步挖掘荔枝PAL基因功能提...
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| 关 键 词： | 荔枝(Litchi chinensis Sonn.) 苯丙氨酸解氨酶 基因家族鉴定 生物信息学 |
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