首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

玉米ACA基因家族生物信息学分析
引用本文:陈逃飞,黄敏,刘睿,杜何为,李曼菲.玉米ACA基因家族生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(13):4188-4201.
作者姓名:陈逃飞  黄敏  刘睿  杜何为  李曼菲
作者单位:长江大学生命科学学院
摘    要:ACA (IIB型Ca2+-ATPase)作为Ca2+-ATPase的亚家族成员之一,参与植物细胞内钙离子浓度维持,并在植物生长发育和非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。为进一步了解玉米ACA (ZmACA)基因家族功能,本研究利用生物信息学方法对ZmACA家族基因进行鉴定与分析。结果表明:玉米共有20个ACA家族基因,命名为ZmACA1~ZmACA20;蛋白质结构具有相似性,氨基酸数目、亲水性指数差异均较小,多数为酸性不稳定的蛋白质。亚细胞定位预测结果显示,ZmACA家族蛋白主要定位于细胞膜、叶绿体、内质网、液泡等部位。进化树分析将ZmACA蛋白分为5个亚家族GroupⅠ~GroupⅤ,其中GroupⅠ~GroupⅣ亚族成员与水稻(Oryza sativa L.)和拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)的亲缘关系较近。蛋白质互作网络(protein-protein interaction network, PPI)预测结果表明,ZmACA6可能与15个蛋白直接互作,是ZmACA家族蛋白的核心成员。ZmACA家族基因在玉米10...

关 键 词:玉米(Zea  mays  L.)  生物信息  ZmACA基因家族  Ca2+-ATP酶
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号