| 大豆SPL基因家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王文丽,董英山,刘晓冬,王玉民,赵洪锟,袁翠平,齐广勋,王英男,郑梅竹,李玉秋.大豆SPL基因家族生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(3):717-728. |
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| 作者姓名： | 王文丽 董英山 刘晓冬 王玉民 赵洪锟 袁翠平 齐广勋 王英男 郑梅竹 李玉秋 |
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| 作者单位： | 1. 长春师范大学生命科学学院;2. 吉林省农业科学院大豆研究所 |
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| 摘 要： | SQUAMOSA启动子结合蛋白样(SPL)转录因子广泛存在于植物中，主要参与植物生长、发育以及多种生理生化过程。为明确大豆SPL基因家族在染色体上的分布、保守结构域、亚族种类、进化关系等，采用生物信息学方法对大豆SPL家族基因进行分析。本研究从大豆基因组数据库中筛选得到43个SPL基因家族成员，系统发育树分析得到5个亚群。保守结构同源性分析发现，SPL基因家族都含有SBP-box的锌指结构和核定位信号。染色体定位发现除14号染色体没有SPL分布外，其他染色体均有不同数量的SPL基因分布。基因加倍、扩张分析表明，大豆SPL基因家族成员之间不存在串联重复，但是存在36对片段重复，表明部分大豆SPL基因可能是由基因重复产生；大豆与拟南芥SPL基因家族之间有29个基因之间存在共线性关系，表明大豆与拟南芥SPL基因家族之间具有较高同源性。本研究对SPL基因家族的进化分析，将有助于理解大豆SPL基因的结构、功能及进化关系，为深入研究大豆SPL基因的功能提供有利的理论依据。
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| 关 键 词： | 大豆 SPL 基因家族 生物信息 转录因子 |
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