| 辣椒花药转录组SSR位点信息分析及标记开发 |
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| 引用本文： | 聂智星,傅鸿妃,李高青,郭赛赛,郑积荣.辣椒花药转录组SSR位点信息分析及标记开发[J].分子植物育种,2023(23):7803-7810. |
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| 作者姓名： | 聂智星 傅鸿妃 李高青 郭赛赛 郑积荣 |
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| 作者单位： | 1. 杭州市农业科学研究院蔬菜研究所;2. 寿光市农业农村局,寿光市蔬菜产业发展中心 |
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| 摘 要： | 为开发高效实用的EST-SSR标记，对辣椒(Capsicum annuum L.)花药样品的转录组进行测序，去冗余后得到44 832条转录本序列。对所有转录本进行SSR分析，共检测出7 189个SSR位点，分布于5 721条转录本上。SSR位点出现频率为16.04%，平均每7.90 kb检出1个SSR位点。分析SSR位点特征发现，97.80%的SSR重复序列长度在10～30 bp之间，单核苷酸和三核苷酸为主要重复基元类型，各占SSR总数的45.31%和35.99%；全部SSR位点共有159种重复基元，除单核苷酸重复外，AG/CT、AAG/CTT为优势重复基元，分别占SSR总数的9.72%和8.43%。随机选择29对EST-SSR引物在8个供试辣椒自交系中进行扩增发现，引物有效性为93.10%，多态率为17.24%。本研究中开发的EST-SSR标记可为辣椒的种质资源遗传多样性分析、分子标记辅助育种等提供支持。
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| 关 键 词： | 辣椒(Capsicum annuum L.) 花药转录组 SSR位点 标记开发 |
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