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| 基于简化基因组测序的籽叶两用茶树遗传分析 | |
| 引用本文： | 李朵姣,江丽,袁名安,胡新荣,郑寨生.基于简化基因组测序的籽叶两用茶树遗传分析[J].分子植物育种,2023(5):1610-1617. |
| 作者姓名： | 李朵姣 江丽 袁名安 胡新荣 郑寨生 |
| 作者单位： | 金华市农业科学研究院 |
| 基金项目： | 金华市重大科技项目(2018-2-001)资助； |
| 摘 要： | 为明确42份籽叶两用茶树资源间的遗传关系，本研究采用双酶切RAD测序技术(ddRAD-seq)对其SNP进行了鉴定。测序数据统计显示：测序质量值Q30的均值为92.43%,GC含量均值为44.04%，共获得28 781 383个高质量SNP，其中纯合突变率均值为25.97%，杂合突变率均值为74.03%，表明其基因组杂合度高；通过SNP变异类型统计发现的6种变异类型以碱基转换为主；基于鉴定到的SNP进行的系统发育树、主成分分析以及遗传结构分析的结果基本一致，结果发现42份资源可以分为2个类群——云南亚种和武夷亚种，两个类群的资源间的亲缘关系较远，遗传多样性差异较大。 |
| 关 键 词： | 籽叶两用茶树 SNP 系统发育树 PCA 遗传结构 |