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狭叶薰衣草叶片转录组耐寒相关差异表达基因分析
引用本文:梁雨晨,蔺海娇,侯一航,李玲,王芊乔,付畅,苑泽宁.狭叶薰衣草叶片转录组耐寒相关差异表达基因分析[J].分子植物育种,2023(14):4568-4578.
作者姓名:梁雨晨  蔺海娇  侯一航  李玲  王芊乔  付畅  苑泽宁
作者单位:哈尔滨师范大学生命科学与技术学院
摘    要:以生长在哈尔滨地区的狭叶薰衣草(Lavandula angustifolia Mill.)为试材,采用高通量转录组测序的方法,研究了田间不同温度(26.67℃, F; 32.07℃, S;-0.76℃, T)对薰衣草叶片基因差异表达的影响,以期挖掘与耐寒相关的功能基因,探讨薰衣草耐寒的分子机制。结果表明,温度对薰衣草差异表达基因具有显著影响,温差越大导致基因差异表达变化越大,差异表达基因与环境因子CCA分析表明温度是诱导基因差异表达的首要因素。在KEGG富集通路中显著富集的有植物与病原体互作通路、MAPK信号通路和昼夜节律通路,在这些通路中,基因Pti5、SUGT1、WRKY25、GI、FKF1等均响应植物低温胁迫并显著表达,且昼夜节律调控对薰衣草耐寒起到重要作用。利用STRING蛋白质互作数据库筛选出KEGG通路中的抗寒相关枢纽基因有FKF1、GI、CRY2等。从转录因子家族中鉴定出1 137个转录因子,隶属于51个转录因子家族,参照拟南芥数据库筛选出的枢纽基因AT4G30825、AT4G17020、AT1G55750均来自bZIP家族,且在KEGG通路中响应低温后表达量普遍升高。通...

关 键 词:薰衣草(Lavandula  angustifolia  Mill.)  转录组测序  差异表达基因  耐寒分子机制
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