| 染井吉野樱PEBP基因家族鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 吴水涵,宋炎峰,李蒙,叶琦,伊贤贵,王绍军,王贤荣.染井吉野樱PEBP基因家族鉴定及生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(7):2152-2160. |
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| 作者姓名： | 吴水涵 宋炎峰 李蒙 叶琦 伊贤贵 王绍军 王贤荣 |
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| 作者单位： | 1. 南京林业大学南方现代林业协同创新中心;2. 南京林业大学生物与环境学院;3. 眉山盛世园林绿化有限责任公司 |
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| 摘 要： | 磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)基因家族的氨基酸结构中存在保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域，对调控植物开花起着至关重要的作用。本研究以染井吉野樱全基因组数据为基础，采用生物信息学方法鉴定出13个PEBP基因，依次命名为PYPEBP1～PYPEBP13，然后进一步分析了家族中各基因结构、理化性质，对PEBP蛋白的亚细胞定位、二级结构以及磷酸化位点进行预测，并构建系统发育树。结果表明，染井吉野樱的PEBP基因家族不同蛋白质序列的长度和特性都存在较大差异；13个染井吉野樱PEBP基因大部分成员含有4个外显子和3个内含子，motif 3、motif 4、motif 5和motif 6是染井吉野樱PEBP基因的特征基序；蛋白的亚细胞定位预测显示，这13个PEBP基因的蛋白分别位于细胞核与细胞质中；蛋白质二级结构分析显示，染井吉野樱PEBP基因的蛋白质二级结构十分相似，PYPEBP5和PYPEBP12蛋白结构中无规则卷曲占比最高，而β-转角比例最低；潜在的磷酸化位点预测分析表明，除PYPEBP3、PYPEBP7、...
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| 关 键 词： | 染井吉野樱 PEBP 生物信息学分析 蔷薇科 |
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