甜玉米液泡转化酶2基因克隆及其等位变异分析 |
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引用本文: | 高玉尧,刘洋,姚艳丽,张秀梅.甜玉米液泡转化酶2基因克隆及其等位变异分析[J].分子植物育种,2023(19):6285-6291. |
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作者姓名: | 高玉尧 刘洋 姚艳丽 张秀梅 |
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作者单位: | 1. 中国热带农业科学院湛江实验站;2. 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 |
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基金项目: | 广东省自然科学基金项目(2020A1515011084); |
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摘 要: | 为了探究液泡转化酶2 (vacuolar invertase 2, VINV2)基因在甜玉米中的等位变异情况,本研究从高糖甜玉米自交系‘B-024’和低糖甜玉米自交系‘B-029’中分离了VINV2等位基因(ZsVINV2-a和ZsVINV2-b)cDNA序列,并对其基因序列、蛋白理化性质、保守结构域与跨膜结构及同源进化关系等进行生物信息学分析。结果显示,ZsVINV2-a和ZsVINV2-b基因最大开放阅读框分别为2 022和2 031 bp,分别编码673和676个氨基酸,且存在2处In/Del和16个SNP,其中1处In/Del存在12个碱基的插入或缺失;ZsVINV2-a和ZsVINV2-b均属于稳定的亲水性蛋白,它们的蛋白分子量分别为72 975.67和73 208.95 Da,且Zs VINV2-a的等电点略低于Zs VINV2-b;这2个蛋白具有糖基水解酶家族32的保守结构域,均在N端有β-呋喃果糖苷酶基序和在C端有半胱氨酸催化结构域;且膜上均有1个跨膜结构域,分别位于氨基酸第41~63处和第43~65处,均属于跨膜蛋白;甜玉米Zs VINV2蛋白与普通玉米的进化关系最为...
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关 键 词: | 甜玉米 基因克隆 生物信息学分析 ZsVINV2 |
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