| 药用植物紫红獐牙菜的转录组信息分析 |
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| 引用本文： | 张婷,张爱丽,周旭红,刘小莉.药用植物紫红獐牙菜的转录组信息分析[J].分子植物育种,2023(21):7025-7036. |
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| 作者姓名： | 张婷 张爱丽 周旭红 刘小莉 |
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| 作者单位： | 1. 云南中医药大学中药学院;2. 云南中医药大学,云南省中医药分子生物学重点实验室;3. 云南中医药大学科研实验中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(81660634)； |
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| 摘 要： | 紫红獐牙菜是重要的民族药，本研究采用高通量测序技术对紫红獐牙菜进行转录组测序并分析。结果显示，完成的15个样品的转录组测序，获得112.17 Gb Clean data，各样品Clean data均达到6.18 Gb,Q30碱基百分比在94.96%及以上。组装后共获得47 106条unigene，其中长度在1 kb以上的unigene有18 971条。通过与KEGG、GO、KOG、COG等多个数据库进行比对，对unigene进行功能注释，共获得35 375条unigene。GO数据库中注释到的26 570条unigene，可分为生物学过程、细胞组分和分子功能三大类共44个亚类。以KEGG数据库为参考，21 321条基因被注释，参与的代谢通路分为5大类，分别是细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、代谢和有机系统，其中与代谢相关的通路最多，约占所用通路的72.5%;KEGG代谢通路分析发现紫红獐牙菜中1 147条unigene参与到22个次生代谢标准通路中，有77条unigene参与编码环烯醚萜苷类合成通路中的25个关键酶。此外，紫红獐牙菜转录组中找到9 027个SSR重复位点，6种SSR...
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| 关 键 词： | 紫红獐牙菜(Swertia purpurea) 转录组 基因注释 次生代谢 |
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