| 番茄RAV基因家族鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王婷,孙虹,任仲海,李强.番茄RAV基因家族鉴定及生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(6):1793-1800. |
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| 作者姓名： | 王婷 孙虹 任仲海 李强 |
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| 作者单位： | 山东农业大学园艺科学与工程学院,山东果蔬优质高效生产协同创新中心,农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,作物生物学国家重点实验室 |
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| 摘 要： | RAV (Related to ABI3/VP1)基因是植物特有的转录因子，在调控胁迫响应和生长发育等过程中起着重要作用。为了明确番茄RAV基因家族成员并为其功能研究奠定基础，本研究在番茄全基因组范围内鉴定了RAV基因并对其进行系统的生物信息学分析。结果表明，番茄中有9个RAV家族基因，可以分为4个分支且同一分支内的基因结构和结构域相对保守。番茄、水稻和拟南芥RAV基因的同源进化关系、基因结构和保守基序分析结果表明，3个物种中的RAV基因的进化相对保守，预示着其功能的相似性。共线性分析结果表明，片段复制事件对番茄RAV基因家族的进化和扩张起着重要作用。与水稻RAV基因相比，番茄和拟南芥的RAV基因的进化关系更近。顺式作用元件分析表明，番茄RAV可能通过参与激素代谢参与逆境胁迫和生长发育等生物学过程。本研究结果揭示了番茄、拟南芥和水稻RAV基因的同源进化关系和番茄RAV基因的潜在功能，为进一步研究番茄RAV基因的生物学功能提供理论基础。
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| 关 键 词： | 番茄 RAV基因家族 共线性分析 |
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