烟草质子泵互作蛋白NTPpi1基因的克隆及其生物信息学分析 |
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引用本文: | 霍光,吴珊,陶德欣,李辉,邸慧慧.烟草质子泵互作蛋白NTPpi1基因的克隆及其生物信息学分析[J].分子植物育种,2024(12):3871-3876. |
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作者姓名: | 霍光 吴珊 陶德欣 李辉 邸慧慧 |
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作者单位: | 1. 湖北省烟草公司恩施州公司;2. 湖南文理学院生命与环境科学学院 |
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摘 要: | 为了能够更好地选育高钾烟草品种,本研究根据烟叶钾元素含量全基因组关联分析结果,克隆了烟草质子泵互作蛋白NTPpi1的基因序列。生物信息学分析发现,NTPpi1基因长度为1 834 bp,开放读码框为981 bp,编码的蛋白质序列由326个氨基酸组成;蛋白质分子量为145.3 kD,蛋白质等电点为5.00;通过在线软件TMHMM 2.0 Server预测发现,该蛋白存在一个跨膜的螺旋结构,且跨膜长度有23个氨基酸。氨基酸序列多序列比对分析结果显示,NTPpi1的氨基酸序列与其他植物Ppi1氨基酸序列的一致性为80.82%。通过NetPhos 3.1 Server软件对质子泵互作蛋白NTPpi1的磷酸化位点进行预测,发现有29个可以磷酸化的位点,其中第321位的Threonine磷酸化位点位于跨膜区域,推测这个位点可能是该蛋白与ATP酶质子泵相互作用的位点。以上结果的发现为高钾烟草品种的选育提供一定的理论支持。
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关 键 词: | 烟草 钾元素 质子泵互作蛋白 |
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