广西壮族自治区猪圆环病毒2型(PCV2)分子流行病学调查及遗传变异分析 |
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引用本文: | 黄美芝,何奇松,冯淑萍,龙凤,尹彦文,莫胜兰,胡丽萍,黄胜斌,韩银华,周庆安,蓝惠华,韦海娜,魏园园,甘雨,施开创.广西壮族自治区猪圆环病毒2型(PCV2)分子流行病学调查及遗传变异分析[J].畜牧与饲料科学,2024(2):109-115. |
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作者姓名: | 黄美芝 何奇松 冯淑萍 龙凤 尹彦文 莫胜兰 胡丽萍 黄胜斌 韩银华 周庆安 蓝惠华 韦海娜 魏园园 甘雨 施开创 |
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作者单位: | 1. 广西壮族自治区南宁市隆安县动物疫病预防控制中心;2. 广西壮族自治区动物疫病预防控制中心 |
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摘 要: | 目的]了解猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)在广西壮族自治区的流行情况及遗传特征。方法]采用PCR方法对广西壮族自治区不同地区送检的病料进行PCV2检测和全基因组序列扩增。应用BioEdit、Mega 7.0、RDP 5和SimPlot(ver 3.5.1)软件对获得的24株PCV2毒株全基因组序列进行核苷酸序列相似性、遗传变异和重组分析,并对Cap蛋白氨基酸序列变异位点进行分析。结果]PCV2广西株基因组大小均为1 768 bp;核苷酸序列相似性分析显示,广西株与参考株PCV1~PCV4的相似性在44.7%~99.7%,与PCV3亲缘性最低;广西株为PCV2b和PCV2d型,PCV2d流行最为广泛;全基因组序列重组分析显示,部分广西株存在重组事件;与疫苗株AY686764-PCV2b和HM641752-PCV2b相比,PCV2广西株的Cap蛋白氨基酸序列共有21个位点发生变异。结论]PCV2广西流行毒株以PCV2d型为主,部分毒株具有重组现象,部分位点发生独特的氨基酸变异,遗传进化趋势明显。研究结果为广西壮族自治区PCV2的流行病学...
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关 键 词: | 猪圆环病毒2型 全基因组 相似性 遗传变异 |
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