| 10种软骨鱼线粒体基因组特征分析 |
| |
| 作者姓名： | 申欣 田美 孟学平 程汉良 |
| |
| 作者单位： | 1. 淮海工学院海洋学院,连云港,222005;中国科学院海洋研究所,青岛,266071
2. 淮海工学院海洋学院,连云港,222005 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，江苏省"青蓝工程"人才基金，江苏省自然科学基金，江苏省海洋生物技术重点建设实验室研究基金，淮海工学院自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | 综合分析了软骨鱼10个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示软骨鱼线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等.软骨鱼10个物种线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因,而且其基因排列完全相同.真鲨目和鳐形目线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1(0.019 1～0.156 4),显示出较强的纯化(负)选择.基于线粒体基因组构建的系统发育树结果显示,软骨鱼纲分为两支:全头亚纲和板鳃亚纲.在板鳃亚纲内部,鳐形目和鲼形目聚为一支;真鲨目、鼠鲨目、须鲨目、虎鲨目和角鲨目聚为一支,其亲缘关系为:{(真鲨目+鼠鲨目)+须鲨目)]+虎鲨目}+角鲨目.软骨鱼线粒体基因组差异位点分析表明,在软骨鱼群体遗传的研究中,had5和nad4基因是理想的分子标记,可以作为coxl基因辅助的分子标记,用于分析软骨鱼不同群体之间的遗传多样性,为其生物多样性的保护及合理利用其生物资源提供更多保障.
|
| 关 键 词： | 软骨鱼纲 线粒体基因组 系统发育 差异位点 分子标记 |
| 收稿时间： | 2010/7/5 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/8/14 0:00:00 |
Analysis of the characteristics of ten cartilaginous fishes mitochondrial genomes |
| |
| Authors: | SHEN Xin TIAN Mei MENG Xue-ping CHENG Han-liang |
| |
| Abstract: | The basic characteristics of chondrichthyes mitochondrial genomes were fully revealed by comprehensive analysis of mitochondrial genomes in ten cartilaginous fishes. Mitochondrial genomes of cartilaginous fishes contain 37 standard metazoan genes and their gene order is identical. The Ka/Ks ratio of 13 mitochondrial proteincoding genes in the Carcharhiniformes and Rajiformes classes is much lower than 1 (0.019 1~0.156 4), indicating a strong purifying selection (negative selection). |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《》下载免费的PDF全文 |
|
