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广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析
引用本文:韦建华,何奇松,冯淑萍,熊毅,胡丽萍,颜健华.广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析[J].广西农业科学,2015,46(5).
作者姓名:韦建华  何奇松  冯淑萍  熊毅  胡丽萍  颜健华
作者单位:1. 河池市动物疫病预防控制中心,广西河池,547000
2. 广西动物疫病预防控制中心,南宁,530001
基金项目:河池市科学研究与技术开发计划项目
摘    要:目的]了解广西马流感病毒(Equine influenza virus,EIV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变化规律,为其疫苗候选毒株的筛选及有效防控马流感疫情奠定基础.方法]采用RT-PCR对广西EIV分离株(A/Equine/Guangxi/1/09,简称GX09株)进行NA基因扩增,经克隆测序及序列比对分析,绘制遗传进化树.结果]GX09株NA基因全长1420 bp,其开放阅读框(ORF)为1413 bp,编码470个氨基酸,包含7个糖基化位点及17个半胱氨酸(Cys)残基.GX09株与参考毒株的NA基因核苷酸同源性为74.7%~99.5%,其推导氨基酸同源性为80.4%~99.4%;与Gansu08株、Heilongjiang08株、Inner mongolia08株及Liaoning08株的核苷酸及其推导氨基酸同源性最高,分别为99.5%和99.4%;与1989年在我国吉林分离获得毒株(Jilin89)的同源性最低,对应的核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为74.7%和80.4%.从遗传进化树可以看出,GX09株与最近几年国内外分离获得的毒株亲缘关系较近,且同属于美洲型分支.结论]目前广西流行的EIV与国内外的流行毒株一致.

关 键 词:马流感病毒  NA基因  克隆  序列分析

Cloning and sequence analysis on NA gene of equine influenza virus(A/Equine/Guangxi/1/09) in Guangxi
WEI Jian-hua,HE Qi-song,FENG Shu-ping,XIONG Yi,HU Li-ping,YAN Jian-hua.Cloning and sequence analysis on NA gene of equine influenza virus(A/Equine/Guangxi/1/09) in Guangxi[J].Guangxi Agricultural Sciences,2015,46(5).
Authors:WEI Jian-hua  HE Qi-song  FENG Shu-ping  XIONG Yi  HU Li-ping  YAN Jian-hua
Abstract:
Keywords:equine influenza virus  NA gene  clone  sequence analysis
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